42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1965 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  100 
 
 		 316 aa  636    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  63.35 
 
 		 407 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  56.65 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  57.86 
 
 		 654 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  54.49 
 
 		 892 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  54.34 
 
 		 664 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  48.12 
 
 		 595 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  49.01 
 
 		 695 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  47.43 
 
 		 351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  46.29 
 
 		 475 aa  129  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  45.51 
 
 		 928 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.01 
 
 		 846 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  44.52 
 
 		 780 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  40.8 
 
 		 617 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  39.78 
 
 		 1040 aa  115  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  45.7 
 
 		 546 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  46.3 
 
 		 967 aa  112  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  42.48 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  51.33 
 
 		 396 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  49.53 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  40.32 
 
 		 399 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  36.67 
 
 		 708 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.75 
 
 		 879 aa  82.8  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  35.66 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  36 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  35.18 
 
 		 706 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  35.18 
 
 		 754 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  36.42 
 
 		 867 aa  80.1  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  35.18 
 
 		 705 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  40.78 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  35.8 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  34.08 
 
 		 686 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  39.2 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  39.2 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  39.2 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  33.51 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  38.4 
 
 		 539 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  40.74 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  37.31 
 
 		 541 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  42.2 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  37.04 
 
 		 539 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1316  S-layer-like protein array-related protein  30.25 
 
 		 426 aa  43.1  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>