171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0485 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0336  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  71.27 
 
 
788 aa  857  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00742342  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4304  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  63.09 
 
 
779 aa  862  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35830  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  67.3 
 
 
761 aa  865  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345904  normal  0.0763221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0736  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  68.42 
 
 
766 aa  906  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22640  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  66.16 
 
 
791 aa  804  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4411  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  66 
 
 
782 aa  847  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.917351  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0310  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  67.14 
 
 
786 aa  839  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.588911  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0485  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  100 
 
 
781 aa  1496  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4826  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  64.81 
 
 
825 aa  832  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32770  vacuolar-type H(+)-translocating pyrophosphatase  68.56 
 
 
768 aa  837  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.506636  normal  0.455841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0602  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  65.63 
 
 
753 aa  820  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0496  Inorganic diphosphatase  65.17 
 
 
777 aa  862  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801124 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1973  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  67.12 
 
 
794 aa  851  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.560457  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4030  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  65.34 
 
 
782 aa  868  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0372  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  67.9 
 
 
792 aa  936  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8448  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  65.95 
 
 
814 aa  827  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0134  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  65.01 
 
 
812 aa  796  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.602726  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0499  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  62.98 
 
 
781 aa  788  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.911328 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5334  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  67.39 
 
 
817 aa  830  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0178305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2761  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  67.24 
 
 
763 aa  858  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.317666  hitchhiker  2.49109e-05 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0223  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  68.83 
 
 
778 aa  862  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0634  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  68.25 
 
 
771 aa  870  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0284  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  70.87 
 
 
786 aa  905  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3559  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.69 
 
 
779 aa  589  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0306706  normal  0.266916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2262  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.76 
 
 
779 aa  588  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0181184  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0829  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.61 
 
 
782 aa  578  1e-163  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00399457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2481  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47 
 
 
775 aa  575  1e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.618403 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3931  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.41 
 
 
705 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  5.43237e-07  normal  0.470613 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0308  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.12 
 
 
682 aa  544  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0186  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.01 
 
 
671 aa  539  1e-152  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4713  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.74 
 
 
671 aa  542  1e-152  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000164217  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1757  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.99 
 
 
694 aa  541  1e-152  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3203  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.8 
 
 
688 aa  538  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1965  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.71 
 
 
694 aa  535  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.36393  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0739  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.49 
 
 
677 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661783  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0686  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.76 
 
 
686 aa  535  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.249632  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1701  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.33 
 
 
746 aa  531  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0933018  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2772  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.03 
 
 
700 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0994  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.92 
 
 
672 aa  525  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3088  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.03 
 
 
710 aa  525  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3408  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.03 
 
 
710 aa  525  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1747  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.26 
 
 
706 aa  524  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264772  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2985  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.33 
 
 
700 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.4507e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7542  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.83 
 
 
715 aa  524  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.61 
 
 
710 aa  521  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1754  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.23 
 
 
681 aa  520  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  7.19333e-06  normal  0.172901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2905  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  46.65 
 
 
690 aa  518  1e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409534  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2182  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.61 
 
 
706 aa  518  1e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.513059  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0934  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  44.35 
 
 
687 aa  516  1e-145  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6803  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.16 
 
 
715 aa  518  1e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2013  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.82 
 
 
653 aa  515  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  4.46892e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0646  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.52 
 
 
681 aa  515  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.27282e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1818  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.47 
 
 
702 aa  515  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1472  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.72 
 
 
689 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.36 
 
 
684 aa  511  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00370015  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3003  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.01 
 
 
692 aa  510  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0566  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.72 
 
 
680 aa  511  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1500  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.62 
 
 
679 aa  509  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1812  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.58 
 
 
694 aa  507  1e-142  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1067  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.37 
 
 
717 aa  507  1e-142  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2995  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.43 
 
 
681 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00639559  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4642  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.9 
 
 
706 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163123  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2666  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.46 
 
 
707 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.362236  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.43 
 
 
681 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000847476  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1528  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.76 
 
 
697 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0306017  normal  0.605169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1192  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.72 
 
 
712 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1622  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.05 
 
 
712 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2253  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.34 
 
 
669 aa  501  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.627571  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0044  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.65 
 
 
674 aa  500  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2023  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.52 
 
 
704 aa  502  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0149188  normal  0.0138521 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.04 
 
 
842 aa  501  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1349  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.08 
 
 
672 aa  498  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.528352  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3012  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.82 
 
 
706 aa  499  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0579  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.95 
 
 
687 aa  498  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33179e-05 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2678  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.76 
 
 
706 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100661  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0418  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.91 
 
 
682 aa  496  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2916  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.58 
 
 
704 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.348085  normal  0.0128697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.64 
 
 
712 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543415  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3239  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.65 
 
 
684 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.98265e-09  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_690  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  42.36 
 
 
679 aa  499  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0341598  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1419  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  45.67 
 
 
683 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0824  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.47 
 
 
711 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.241185  normal  0.154446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1252  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.44 
 
 
694 aa  498  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2668  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.69 
 
 
693 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0348916  normal  0.165448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0827  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.78 
 
 
680 aa  492  1e-138  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000434939  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2641  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.48 
 
 
707 aa  495  1e-138  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0756  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  41.77 
 
 
711 aa  494  1e-138  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.145691  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1225  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  44.02 
 
 
654 aa  491  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0784  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  41.94 
 
 
679 aa  491  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3291  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.51 
 
 
680 aa  492  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2524  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.88 
 
 
718 aa  492  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3307  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.9 
 
 
675 aa  490  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.903662 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0764  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.69 
 
 
775 aa  487  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2414  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.29 
 
 
672 aa  487  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0657  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.8 
 
 
711 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2299  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.26 
 
 
732 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48137  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1141  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.63 
 
 
712 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1919  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  43.07 
 
 
693 aa  488  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0023  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  41.78 
 
 
686 aa  485  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0771  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.54 
 
 
718 aa  485  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>