More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2111 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 211 aa  434  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  40.35 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  41.96 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  40.45 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1410  radical SAM domain protein  42.53 
 
 		 211 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  39.91 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  39.11 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  38.67 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  40.09 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  40.09 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  40.18 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  37.84 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  39.11 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  39.11 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  39.11 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  39.11 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  39.11 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  38.22 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  38.22 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  39.11 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  39.11 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  38.22 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  38.5 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  41.18 
 
 		 210 aa  121  7e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  37.78 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  38.22 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  40.18 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  38.22 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  38.22 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  38.05 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  38.84 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  38.22 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  39.38 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  37.33 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3190  hypothetical protein  38.05 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241224  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  37.67 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  38.84 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  38.65 
 
 		 205 aa  118  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  37.38 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  38.91 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  39.11 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  37.99 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1124  radical SAM domain protein  40.43 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1161  Radical SAM domain protein  39.73 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  38.07 
 
 		 209 aa  114  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  37.89 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  38.77 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  38.05 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  37.44 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0794  hypothetical protein  37.23 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  37.39 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  37.83 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2298  hypothetical protein  40.18 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  37.61 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  33.17 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  39.21 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  38.57 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  38.29 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  39.91 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2039  hypothetical protein  38.5 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  32.83 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  37.39 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  36.94 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  34.5 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6747  radical SAM domain-containing protein  38.22 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  40.26 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  37.86 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0597  hypothetical protein  39.13 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1115  radical SAM domain-containing protein  37.67 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  32.84 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  33.5 
 
 		 193 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  35.06 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  34.91 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  34.91 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  32.86 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  33.5 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  30.8 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  34.78 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1081  hypothetical protein  38.46 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  32.73 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4381  hypothetical protein  33.6 
 
 		 237 aa  99.4  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  30.67 
 
 		 226 aa  99.4  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  32.83 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  30.8 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  36.79 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  40.31 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  29.77 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  33.19 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  28.57 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  30.85 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  33.17 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  35.56 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  33.65 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  32.77 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  26.73 
 
 		 225 aa  95.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  37.26 
 
 		 210 aa  94.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0734  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0750  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>