67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2401 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  100 
 
 		 307 aa  614  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  43.05 
 
 		 289 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  45.02 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  41.84 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  43.57 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  43.57 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  43.57 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  43.57 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  43.57 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  43.57 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  40.78 
 
 		 296 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  43.57 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1036  membrane protein  42.81 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  43.84 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1032  membrane protein  43.48 
 
 		 290 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  42.91 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1154  membrane protein  42.96 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0675  membrane protein  42.96 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1130  membrane protein  43 
 
 		 289 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2151  membrane protein  43.91 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  41.7 
 
 		 274 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2443  membrane protein-like protein  37.55 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  29.68 
 
 		 315 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  27.31 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  27.51 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  28.95 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  27.63 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  29.22 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  28.1 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  28.41 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  28.51 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  26.72 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  25.26 
 
 		 691 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  25.97 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  24.53 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  25.6 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  25.09 
 
 		 687 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  26.3 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  26.27 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  23.88 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  23.81 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  26.75 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  24.14 
 
 		 678 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  22.66 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  24.42 
 
 		 679 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  25.94 
 
 		 692 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  22.15 
 
 		 718 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  23.86 
 
 		 681 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  24.09 
 
 		 686 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  26.27 
 
 		 664 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  22.62 
 
 		 254 aa  46.2  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  25.4 
 
 		 719 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  25.18 
 
 		 651 aa  46.2  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.64 
 
 		 654 aa  46.2  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25 
 
 		 683 aa  46.2  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  23.81 
 
 		 752 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  22.34 
 
 		 651 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  23.16 
 
 		 665 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  24.91 
 
 		 672 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  23.16 
 
 		 665 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  22.88 
 
 		 718 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  23.16 
 
 		 665 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  23.18 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  25.18 
 
 		 722 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  23.55 
 
 		 676 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  24.72 
 
 		 708 aa  42.7  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  20.15 
 
 		 613 aa  42.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>