30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5083 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 
197 aa  406  1e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  51.3 
 
 
198 aa  194  5e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  49.48 
 
 
202 aa  190  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  49.22 
 
 
198 aa  184  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.96 
 
 
190 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  38.3 
 
 
189 aa  132  2e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0163  hypothetical protein  27.32 
 
 
197 aa  70.5  1e-11  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  28.42 
 
 
195 aa  70.9  1e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.98 
 
 
191 aa  70.1  2e-11  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.23 
 
 
197 aa  65.1  6e-10  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.56 
 
 
204 aa  65.1  7e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.21 
 
 
172 aa  57  2e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.27 
 
 
193 aa  57  2e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  23.45 
 
 
196 aa  52  5e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  23.45 
 
 
196 aa  52  6e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  1.01589e-06 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  19.42 
 
 
206 aa  50.8  1e-05  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  22.16 
 
 
194 aa  50.8  1e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  26.56 
 
 
190 aa  50.4  2e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  21.81 
 
 
200 aa  48.9  5e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  24.61 
 
 
204 aa  48.9  5e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  26.89 
 
 
206 aa  48.5  6e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  23.39 
 
 
545 aa  48.5  6e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.96 
 
 
205 aa  48.1  9e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1121  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.65 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00306765  normal  0.769752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.19 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  27.27 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  22.5 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  1.76829e-05 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.26 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  24.21 
 
 
234 aa  42.4  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  23.16 
 
 
196 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>