46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0979 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0979  outer membrane protein  100 
 
 		 194 aa  378  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1842  outer membrane protein OmpH  28.95 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00348927  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  27.88 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  27.88 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  27.88 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03228  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  27.06 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002755  outer membrane chaperone Skp (OmpH) precursor  28.02 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  25.81 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  24.19 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0950  periplasmic chaperone  27.88 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.31 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3351  periplasmic chaperone  26.67 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00292396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0716  periplasmic chaperone  25.81 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000710981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.81 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0818  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  39.62 
 
 		 139 aa  48.9  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.78632  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.38 
 
 		 167 aa  47.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.55 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.55 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.55 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.55 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2093  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.14 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000603573  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  23.78 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0251  periplasmic chaperone  28.72 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.963542  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0263  periplasmic chaperone  28.72 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.4974 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0266  periplasmic chaperone  28.72 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000300705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0247  periplasmic chaperone  28.72 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103395  normal  0.490215 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.78 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0247  periplasmic chaperone  28.72 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.414945 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  23.63 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  26.83 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  26.29 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.86 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.59 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.59 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  25.13 
 
 		 172 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  25.66 
 
 		 172 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.42 
 
 		 165 aa  42.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4026  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.78 
 
 		 212 aa  42  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318638  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.35 
 
 		 165 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000137224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.35 
 
 		 165 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000309047  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.35 
 
 		 165 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  25.27 
 
 		 175 aa  41.2  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  25.19 
 
 		 171 aa  41.2  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>