37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2346 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 
368 aa  764  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  56.34 
 
 
358 aa  415  1e-115  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  54.91 
 
 
843 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  51.11 
 
 
363 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  50.56 
 
 
383 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  49.44 
 
 
366 aa  347  3e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  48.16 
 
 
377 aa  338  8e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  48.6 
 
 
357 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  45.63 
 
 
955 aa  310  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  43.94 
 
 
364 aa  301  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0319  hypothetical protein  44.1 
 
 
358 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0298  hypothetical protein  44.16 
 
 
358 aa  299  6e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  41.89 
 
 
1077 aa  297  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0304  hypothetical protein  44.57 
 
 
358 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  44.16 
 
 
358 aa  295  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0253  hypothetical protein  43.59 
 
 
358 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  43.33 
 
 
787 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.58 
 
 
734 aa  284  2e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  40.87 
 
 
381 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.64 
 
 
734 aa  277  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  40.68 
 
 
686 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  37.19 
 
 
1082 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0273  hypothetical protein  44.92 
 
 
317 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  38.34 
 
 
695 aa  263  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0259  hypothetical protein  44.92 
 
 
317 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  39.89 
 
 
1247 aa  258  9e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1198  WbwX  37.99 
 
 
361 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.696944  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  39.95 
 
 
751 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  39.95 
 
 
751 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  37.08 
 
 
372 aa  239  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 
882 aa  221  1e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.2 
 
 
957 aa  216  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2508  hypothetical protein  26.61 
 
 
381 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.56846e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2521  hypothetical protein  26.36 
 
 
381 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  5.40402e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4007  polysaccharide biosynthesis protein  67.39 
 
 
47 aa  70.1  6e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  20.95 
 
 
576 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3361  hypothetical protein  27.5 
 
 
355 aa  43.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.148862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>