262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1631 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1631  bacterioferritin  100 
 
 
155 aa  315  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000261591  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  72.73 
 
 
155 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  72.08 
 
 
155 aa  233  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  70.97 
 
 
155 aa  231  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0105  bacterioferritin  68.18 
 
 
155 aa  216  8.999999999999998e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  53.25 
 
 
161 aa  164  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0966  bacterioferritin  49.02 
 
 
154 aa  158  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00605271  hitchhiker  0.0000000255708 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3758  bacterioferritin  50.65 
 
 
161 aa  154  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  46.75 
 
 
156 aa  148  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  47.74 
 
 
158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  46.45 
 
 
159 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2242  bacterioferritin  49.68 
 
 
156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  45.81 
 
 
159 aa  143  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1277  bacterioferritin  47.1 
 
 
156 aa  141  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  47.4 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  47.4 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  47.4 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  47.4 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  47.4 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  47.1 
 
 
157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  46.45 
 
 
157 aa  136  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  47.71 
 
 
158 aa  136  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  46.45 
 
 
158 aa  134  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  46.45 
 
 
158 aa  134  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  46.45 
 
 
158 aa  134  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  45.45 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  46 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  45.81 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  45.81 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  45.81 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  45.81 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  45.81 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  44.81 
 
 
154 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  44.52 
 
 
157 aa  133  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  45.16 
 
 
158 aa  133  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  45.81 
 
 
158 aa  133  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  46.36 
 
 
160 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  44.52 
 
 
157 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  45.64 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  46.45 
 
 
159 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  43.87 
 
 
159 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  42.21 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  44.81 
 
 
158 aa  127  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  42.86 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  44.81 
 
 
157 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  44.81 
 
 
157 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  44.81 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  45.16 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  44.81 
 
 
157 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  43.87 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  44.81 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  44.81 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  44.3 
 
 
158 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  43.51 
 
 
158 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  44.52 
 
 
156 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  44.16 
 
 
157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  42.95 
 
 
161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  44.16 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  42.21 
 
 
157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  44.3 
 
 
180 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  44.3 
 
 
158 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  44.3 
 
 
158 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  44.3 
 
 
158 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  44.3 
 
 
158 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  44.3 
 
 
158 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  44.3 
 
 
158 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  44.44 
 
 
159 aa  124  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  43.62 
 
 
158 aa  123  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  44.97 
 
 
224 aa  124  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  44.67 
 
 
157 aa  124  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  42.28 
 
 
161 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  43.62 
 
 
158 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2076  bacterioferritin  41.56 
 
 
159 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.790215  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  40.94 
 
 
161 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  42.95 
 
 
161 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  42.95 
 
 
158 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  44.3 
 
 
159 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  43.79 
 
 
172 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  44.3 
 
 
159 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  43.87 
 
 
159 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  42.95 
 
 
158 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  42.95 
 
 
158 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  43.87 
 
 
159 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  42.95 
 
 
158 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  42.95 
 
 
158 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  42 
 
 
165 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  41.94 
 
 
159 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  42.21 
 
 
161 aa  121  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  43.23 
 
 
159 aa  121  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  42.58 
 
 
156 aa  121  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  44.16 
 
 
157 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  41.18 
 
 
159 aa  121  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  43.87 
 
 
156 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  43.14 
 
 
158 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  42.28 
 
 
161 aa  120  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  42.28 
 
 
161 aa  120  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  42.86 
 
 
159 aa  120  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  41.29 
 
 
160 aa  120  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  42.95 
 
 
161 aa  120  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2230  bacterioferritin  40.65 
 
 
156 aa  120  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>