More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1420 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  82.52 
 
 
665 aa  949    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  83.7 
 
 
584 aa  967    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  84.05 
 
 
584 aa  995    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  84.91 
 
 
584 aa  1004    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2840  SSS sodium solute transporter superfamily  68.56 
 
 
661 aa  827    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  81.07 
 
 
665 aa  969    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  84.56 
 
 
584 aa  1000    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  60.82 
 
 
657 aa  779    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3288  Na+/solute symporter  70.51 
 
 
655 aa  835    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  79.83 
 
 
661 aa  946    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1340  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  67.87 
 
 
655 aa  850    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  60.3 
 
 
659 aa  760    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  81.28 
 
 
664 aa  939    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 
659 aa  1322    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  69.15 
 
 
662 aa  827    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  48.69 
 
 
513 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  46.98 
 
 
516 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  46.8 
 
 
516 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  46.8 
 
 
516 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  46.63 
 
 
516 aa  502  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  46.63 
 
 
516 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  46.8 
 
 
516 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  46.8 
 
 
516 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.98 
 
 
516 aa  504  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  46.29 
 
 
516 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  46.63 
 
 
516 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  48.6 
 
 
511 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.41 
 
 
516 aa  498  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.28 
 
 
530 aa  480  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  42.08 
 
 
577 aa  456  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  46.84 
 
 
568 aa  455  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.59 
 
 
539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  41.26 
 
 
519 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  41.44 
 
 
515 aa  452  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  43.25 
 
 
541 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  47.01 
 
 
536 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  43.25 
 
 
541 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  42.55 
 
 
559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  43.17 
 
 
572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.73 
 
 
541 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  41.54 
 
 
576 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  43.55 
 
 
577 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.95 
 
 
575 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  45.5 
 
 
537 aa  438  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0531  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.52 
 
 
508 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5185  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.44 
 
 
508 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0958  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.91 
 
 
570 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.47 
 
 
536 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0970  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.83 
 
 
516 aa  435  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.45 
 
 
557 aa  435  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  46.89 
 
 
576 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  41.88 
 
 
554 aa  434  1e-120  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  43.31 
 
 
563 aa  435  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.18 
 
 
515 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  46.89 
 
 
576 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  42.68 
 
 
513 aa  429  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.62 
 
 
557 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.41 
 
 
543 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252386  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  39.68 
 
 
554 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5957  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.07 
 
 
577 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  41.26 
 
 
554 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  41.23 
 
 
552 aa  426  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3782  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.72 
 
 
563 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804193  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  39.94 
 
 
554 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  48.11 
 
 
571 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  40.62 
 
 
552 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  39.52 
 
 
554 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.39 
 
 
560 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3142  acetate permease  41.46 
 
 
576 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  40.89 
 
 
551 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2139  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.91 
 
 
543 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  41.06 
 
 
551 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  43.11 
 
 
561 aa  422  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3879  acetate permease  47.63 
 
 
576 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262245  normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  40.79 
 
 
552 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  48.31 
 
 
546 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2501  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.75 
 
 
607 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000632414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  45.99 
 
 
528 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  40.24 
 
 
553 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0428  Na+/solute symporter  45.31 
 
 
559 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400759  decreased coverage  0.0000917486 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.05 
 
 
552 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0694  SSS sodium solute transporter superfamily  45.35 
 
 
543 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.81 
 
 
534 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5873  acetate permease  46.58 
 
 
553 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  41.29 
 
 
563 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  43.1 
 
 
551 aa  412  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4960  Na+/solute symporter  45.23 
 
 
544 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319543  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  39.42 
 
 
551 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5783  acetate permease  47.46 
 
 
553 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2954  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.88 
 
 
563 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  41.29 
 
 
563 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  40.95 
 
 
548 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  39.42 
 
 
551 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  39.26 
 
 
551 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  39.69 
 
 
550 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4284  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.92 
 
 
541 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231008  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  45.95 
 
 
574 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0375  acetate permease  41.26 
 
 
553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  40.31 
 
 
666 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4130  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.92 
 
 
541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502613  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>