37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1319 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1319  prevent-host-death family protein  100 
 
 
94 aa  191  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000582533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2622  prevent-host-death family protein  76.09 
 
 
96 aa  145  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  34.41 
 
 
93 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2194  prevent-host-death family protein  31.03 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2978  prevent-host-death family protein  27.59 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.453254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  32.14 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  30.77 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  30.12 
 
 
97 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  27.78 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7794  hypothetical protein  29.76 
 
 
94 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  28.75 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3421  prevent-host-death family protein  28.75 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02595  hypothetical protein  26.88 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0848  prevent-host-death family protein  24.73 
 
 
99 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  29.55 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0908  prevent-host-death protein  28.38 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00165129  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  30 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  30 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1166  prevent-host-death family protein  28.41 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0921  prevent-host-death family protein  25.58 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.387734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  26.67 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  28.75 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2696  prevent-host-death family protein  25.29 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752077  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11273  hypothetical protein  26.44 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00877977  hitchhiker  0.00820754 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0915  prevent-host-death protein  31.17 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.752928  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1353  prevent-host-death family protein  27.78 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.906372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1747  prevent-host-death family protein  26.32 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3171  prevent-host-death family protein  26.32 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5487  prevent-host-death family protein  33.68 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2562  prevent-host-death family protein  28 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0835616  normal  0.0155053 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  26.25 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2681  prevent-host-death family protein  25.58 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0623727  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02601  hypothetical protein  27.78 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  28.57 
 
 
87 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003261  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  27.78 
 
 
85 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0542  hypothetical phage-related protein  32.26 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317857  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  32.1 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>