18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0100 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 371 aa  733    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1269  hypothetical protein  44.95 
 
 		 331 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000022202  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  32.77 
 
 		 146 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1326  hypothetical protein  35.09 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000243968  hitchhiker  0.00621187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  26.88 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  24.68 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  30.77 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  36.07 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4526  hypothetical protein  31.33 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0155  putative transmembrane anti-sigma factor  29.69 
 
 		 203 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000067167  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  41.38 
 
 		 223 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0351  putative transmembrane anti-sigma factor  34.21 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0304335 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  34.78 
 
 		 91 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  37.8 
 
 		 244 aa  43.9  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.68 
 
 		 255 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2018  putative transmembrane anti-sigma factor  30.56 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0151  putative transmembrane anti-sigma factor  28.57 
 
 		 203 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  46.81 
 
 		 259 aa  43.1  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>