More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4949 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 297 aa  578  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.49 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.28 
 
 		 310 aa  245  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  51.27 
 
 		 620 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  32.41 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2836  gas vesicle protein GvpN  31.48 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.74 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  33.72 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1750  gas vesicle protein GvpN  30.4 
 
 		 335 aa  87  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  29.34 
 
 		 376 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1815  gas vesicle protein GvpN  28.97 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2334  gas vesicle protein GvpN  31.65 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206524 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1255  gas vesicle protein GvpN  28.78 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  32.47 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.41 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2329  gas vesicle protein GvpN  28.21 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399542 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  33.96 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  32.57 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  35.22 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  35.22 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0076  ATPase associated with various cellular activities  29.38 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0615822  decreased coverage  0.000700861 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2146  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.15 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0058  gas vesicle protein GvpN  30.33 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0714681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  31.43 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0692  ATPase  28.5 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4249  ATPase  29.69 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.45 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2273  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.8 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  29.09 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  32.9 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  30.99 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  30 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  32.9 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  32.9 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  32.9 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  32.9 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  32.9 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  32.9 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  32.26 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.96 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.28 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  34.24 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.88 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  32.9 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  30.41 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  31.28 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2110  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.42 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.625563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  32.9 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.94 
 
 		 380 aa  75.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  29.71 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.58 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.58 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  31.95 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  35.71 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  29.79 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  34.66 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  28.94 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.73 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.56 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  32.18 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  34.66 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.26 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.829729  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  35.71 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3031  gas vesicle protein GvpN  26.61 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  34.66 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  32.4 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  31.84 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  28.35 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.54 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08430  MoxR-like ATPase  28.47 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  33.72 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  30.73 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  34.38 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.07 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  34.09 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.56 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3272  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0220778  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.48 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  30.86 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.05 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  31.61 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  33.56 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0330  hypothetical protein  28.71 
 
 		 437 aa  72.8  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.608164 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.8 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4628  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.03 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1895  ATPase  34.59 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  35.71 
 
 		 355 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  30.23 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  31.02 
 
 		 365 aa  72.4  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0582  hypothetical protein  25.86 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4514  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.03 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0165185  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  29.94 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4146  ATPase  35.03 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.661035 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  30.23 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  29.49 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  33.33 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.91 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  31.02 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.88 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>