80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1393 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1393  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
146 aa  297  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0137  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  77.24 
 
 
145 aa  242  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0449  methylmalonyl-CoA epimerase  74.31 
 
 
145 aa  232  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3375  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.1 
 
 
151 aa  232  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1910  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.72 
 
 
145 aa  226  9e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33780  methylmalonyl-CoA epimerase  73.79 
 
 
145 aa  224  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0248  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.68 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2371  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.1 
 
 
141 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1648  methylmalonyl-CoA epimerase  42.14 
 
 
158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.284191  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.36 
 
 
158 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437293  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2860  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.26 
 
 
146 aa  118  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0855  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.36 
 
 
144 aa  117  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3522  hypothetical protein  40.43 
 
 
150 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1674  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.72 
 
 
150 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6081  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1622  hypothetical protein  40.85 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1931  hypothetical protein  40.85 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.269466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1882  hypothetical protein  40.85 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1935  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.43 
 
 
141 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00196313  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5785  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.13 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932614  normal  0.0358814 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2383  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.76 
 
 
150 aa  110  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611543  normal  0.517955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2489  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.3 
 
 
148 aa  110  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1675  hypothetical protein  39.58 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1810  hypothetical protein  39.58 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.281352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1856  hypothetical protein  40.14 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.32929e-27 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2554  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.86 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298354  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.36 
 
 
146 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3577  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.51 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502389  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2063  hypothetical protein  39.45 
 
 
132 aa  87.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4748  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.17 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2970  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495253  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2737  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.98 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0870171  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2201  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.38 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0725  hypothetical protein  30.53 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.542377  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  29.66 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0029  glyoxalase family protein  36.28 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  30.22 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  30 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0273  hypothetical protein  27.43 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0262  hypothetical protein  27.43 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199971  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0257  hypothetical protein  27.43 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7167  putative glyoxylase family protein  29.75 
 
 
199 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  27.21 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3428  glyoxalase family protein  29.5 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0993579  hitchhiker  0.000000357721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0257  hypothetical protein  27.43 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.74773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1163  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.66 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.317996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  29 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  26.96 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.5 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533955  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0276  hypothetical protein  27.43 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.93 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0026  glyoxalase family protein  30.63 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.9 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1752  glyoxalase family protein  29.66 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000441097  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2533  lactoylglutathione lyase  27.59 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42336  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1946  glyoxalase family protein  29.66 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5587800000000002e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1730  glyoxalase family protein  29.66 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00522629  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.76 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0198  hypothetical protein  26.76 
 
 
129 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  30.97 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1773  glyoxalase family protein  29.66 
 
 
139 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00831345  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1910  glyoxalase family protein  29.66 
 
 
139 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000915588  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0191  hypothetical protein  27.46 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00184  hypothetical protein  27.46 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.883797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3473  hypothetical protein  27.46 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.815895  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0180  hypothetical protein  27.46 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  31.25 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0197  hypothetical protein  27.46 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00185  predicted lyase  27.46 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2113  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
204 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00675157  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  28.32 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1946  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.81 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1995  glyoxalase family protein  28.78 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  27.18 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.46 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1251  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.59 
 
 
143 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3416  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.76 
 
 
129 aa  40  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1341  methylmalonyl-CoA epimerase  22.64 
 
 
136 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.886384  normal  0.16528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>