More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0219 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0694  SSS sodium solute transporter superfamily  68.01 
 
 
543 aa  645    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06910  SSS sodium solute transporter  68.51 
 
 
540 aa  670    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  70.26 
 
 
528 aa  665    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2862  Na+/solute symporter  71.14 
 
 
537 aa  670    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2139  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  68.13 
 
 
543 aa  652    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12100  SSS sodium solute transporter  70.6 
 
 
532 aa  664    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24513  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1075  SSS sodium solute transporter superfamily  70.73 
 
 
546 aa  664    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.099805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1967  SSS sodium solute transporter superfamily  72.27 
 
 
552 aa  711    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.732438  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13340  SSS sodium solute transporter  70.09 
 
 
556 aa  684    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0683463  normal  0.0921974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3659  SSS sodium solute transporter superfamily  72.74 
 
 
542 aa  698    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.641913  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4055  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  66.91 
 
 
541 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.647451  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03080  SSS sodium solute transporter  66.05 
 
 
528 aa  645    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3373  SSS sodium solute transporter superfamily  71.24 
 
 
536 aa  706    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346982  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1378  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  68.3 
 
 
538 aa  672    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1396  SSS sodium solute transporter superfamily  71.54 
 
 
538 aa  672    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000408051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4130  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  66.91 
 
 
541 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502613  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  67.58 
 
 
543 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252386  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4284  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  67.46 
 
 
541 aa  664    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231008  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0219  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 
552 aa  1072    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5174  SSS sodium solute transporter superfamily  63.23 
 
 
525 aa  627  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  61.94 
 
 
568 aa  600  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1814  SSS sodium solute transporter superfamily  64.81 
 
 
545 aa  595  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  64.13 
 
 
536 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  61.86 
 
 
536 aa  578  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  62.92 
 
 
537 aa  570  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  61.44 
 
 
557 aa  568  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  61.25 
 
 
557 aa  566  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  61.97 
 
 
534 aa  561  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3815  Na+/solute symporter  57.84 
 
 
584 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  58.82 
 
 
551 aa  531  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  54.45 
 
 
561 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.9 
 
 
530 aa  493  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  49.08 
 
 
519 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  47.5 
 
 
516 aa  463  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  47.5 
 
 
516 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  47.68 
 
 
516 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  47.68 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  47.68 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  47.68 
 
 
516 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.5 
 
 
516 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  47.68 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  47.68 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  47.31 
 
 
516 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.58 
 
 
516 aa  458  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  47.96 
 
 
515 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.88 
 
 
515 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  47.59 
 
 
513 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.58 
 
 
539 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.55 
 
 
659 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  47.19 
 
 
559 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  46.49 
 
 
541 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  46.3 
 
 
554 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  46.68 
 
 
541 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  46.11 
 
 
554 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.13 
 
 
541 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  47.88 
 
 
511 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  46.3 
 
 
554 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  46.3 
 
 
554 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  46.63 
 
 
577 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  45.57 
 
 
552 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  48.82 
 
 
572 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  47.38 
 
 
571 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  45.68 
 
 
576 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  45.17 
 
 
574 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3879  acetate permease  46.92 
 
 
576 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262245  normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3142  acetate permease  46.92 
 
 
576 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  45.86 
 
 
576 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  45.68 
 
 
576 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  45.09 
 
 
563 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.69 
 
 
575 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  45.54 
 
 
513 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  43.87 
 
 
554 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5957  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.58 
 
 
577 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  44.48 
 
 
551 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  44.63 
 
 
552 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  45.74 
 
 
552 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  45.28 
 
 
551 aa  415  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  45.28 
 
 
551 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  44.67 
 
 
551 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  45.28 
 
 
551 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2994  Na+/solute symporter  48.18 
 
 
632 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.77047  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  44.44 
 
 
552 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  45.37 
 
 
552 aa  411  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  45.3 
 
 
550 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03252  acetate permease  45.34 
 
 
562 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  45.47 
 
 
549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  45.29 
 
 
549 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  42.78 
 
 
584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  45.47 
 
 
549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0375  acetate permease  45.74 
 
 
553 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  45.47 
 
 
549 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  45.47 
 
 
549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  42.86 
 
 
665 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  45.47 
 
 
549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  45.47 
 
 
549 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  45.47 
 
 
549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5873  acetate permease  45.19 
 
 
553 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1449  acetate permease  44.11 
 
 
574 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.463386  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  43.17 
 
 
577 aa  403  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  45.74 
 
 
549 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>