26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2179 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2179  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 355 aa  728    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209398  hitchhiker  0.000230453 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.92 
 
 		 327 aa  135  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0770  glycosyl transferase, group 2 family protein  28 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.41 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  23.36 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  22.31 
 
 		 304 aa  53.1  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  22.99 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  24.07 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  24.3 
 
 		 302 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  25.78 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  23.14 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  21.65 
 
 		 754 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  20.48 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  22.27 
 
 		 323 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  23.01 
 
 		 297 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  22.81 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  22.29 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  23.61 
 
 		 619 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  24.79 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  24.22 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>