More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2128 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2128  butyrate kinase  100 
 
 
362 aa  743    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2844  butyrate kinase  80.97 
 
 
358 aa  599  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2106  butyrate kinase  82.2 
 
 
359 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2307  butyrate kinase  54.26 
 
 
370 aa  411  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0263  butyrate kinase  54.19 
 
 
370 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4236  butyrate kinase  50 
 
 
367 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4184  butyrate kinase  50 
 
 
367 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000389222 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4069  butyrate kinase  50 
 
 
367 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3907  butyrate kinase  50 
 
 
367 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3916  butyrate kinase  50 
 
 
367 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0615579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4386  butyrate kinase  50 
 
 
367 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0939  butyrate kinase  52.71 
 
 
355 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2858  butyrate kinase  49.16 
 
 
367 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0960  butyrate kinase  49.72 
 
 
367 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0659702 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4294  butyrate kinase  49.44 
 
 
367 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4005  butyrate kinase  50 
 
 
367 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4274  butyrate kinase  49.44 
 
 
367 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2656  butyrate kinase  48.86 
 
 
356 aa  371  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2342  butyrate kinase  48.58 
 
 
356 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1680  butyrate kinase  49.44 
 
 
358 aa  362  4e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00170652  normal  0.0185756 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0108  butyrate kinase  48.18 
 
 
361 aa  359  5e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.835306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2358  butyrate kinase  49.3 
 
 
362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0714814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01633  butyrate kinase  52.62 
 
 
360 aa  355  5e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1109  butyrate kinase  47.22 
 
 
361 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0590  butyrate kinase  49.16 
 
 
361 aa  352  7e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1069  butyrate kinase  48.31 
 
 
375 aa  351  1e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0107  butyrate kinase  47.47 
 
 
363 aa  349  4e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3152  butyrate kinase  48.01 
 
 
357 aa  349  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0936  butyrate kinase  49.72 
 
 
353 aa  346  4e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1472  butyrate kinase  48.16 
 
 
355 aa  344  2e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2348  butyrate kinase  45.74 
 
 
352 aa  340  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311163  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0109  butyrate kinase  48.43 
 
 
356 aa  331  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06760  butyrate kinase  46.59 
 
 
356 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2852  butyrate kinase  46.88 
 
 
361 aa  326  5e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0106  butyrate kinase  46.09 
 
 
357 aa  325  5e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2700  butyrate kinase  46.02 
 
 
352 aa  322  5e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21870  butyrate kinase  45.53 
 
 
359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3544  butyrate kinase  43.47 
 
 
362 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.505108  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1470  butyrate kinase  44.38 
 
 
362 aa  297  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1366  butyrate kinase  43.48 
 
 
370 aa  294  2e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1041  butyrate kinase  43.22 
 
 
357 aa  280  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.496289  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0591  butyrate kinase  43.02 
 
 
362 aa  278  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1071  butyrate kinase  42.66 
 
 
357 aa  276  4e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2626  butyrate kinase  36.27 
 
 
453 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3128  butyrate kinase  37.64 
 
 
372 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0042  butyrate kinase  39.89 
 
 
368 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0454  butyrate kinase  38.84 
 
 
359 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0058  butyrate kinase  39.89 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.870551  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2330  butyrate kinase  37.22 
 
 
372 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0046  butyrate kinase  39.6 
 
 
376 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0045  butyrate kinase  37.32 
 
 
366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.90675 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1383  butyrate kinase  32.18 
 
 
356 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000142085  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0258  Butyrate kinase  36.1 
 
 
333 aa  119  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  27.11 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  34.52 
 
 
422 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  25.8 
 
 
772 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  27.82 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7535  acetate kinase  29.56 
 
 
381 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315075  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  28 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  32.28 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  31.74 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  29.34 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  26.2 
 
 
397 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  28.14 
 
 
402 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  31.07 
 
 
400 aa  72.8  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  27.37 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  32.12 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  25.71 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  24.49 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  26.55 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  24.55 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  31.52 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  31.52 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  29.17 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  29.75 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  32.2 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  27.54 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  25.46 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  27.54 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  26.42 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  29.65 
 
 
589 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0641  acetate kinase  23.81 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00773095  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0354  acetate kinase  24.4 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  32.14 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  33.13 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  25.54 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4397  acetate kinase  29.68 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  25.93 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1162  acetate kinase  27.59 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  32.53 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  25.8 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  29.44 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1272  acetate kinase  28.5 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0858677  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  29.68 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  29.89 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10414  acetate kinase  28.48 
 
 
385 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  29.95 
 
 
398 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  28.75 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  25.73 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3504  acetate kinase  27.94 
 
 
405 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>