More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01633 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01633  butyrate kinase  100 
 
 
360 aa  737    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0939  butyrate kinase  54.86 
 
 
355 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2656  butyrate kinase  52.99 
 
 
356 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2342  butyrate kinase  52.71 
 
 
356 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2307  butyrate kinase  52.68 
 
 
370 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2128  butyrate kinase  52.62 
 
 
362 aa  355  5e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0263  butyrate kinase  53.52 
 
 
370 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4005  butyrate kinase  48.17 
 
 
367 aa  341  9e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4069  butyrate kinase  48.17 
 
 
367 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3907  butyrate kinase  48.17 
 
 
367 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3916  butyrate kinase  48.17 
 
 
367 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0615579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2858  butyrate kinase  48.73 
 
 
367 aa  340  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4386  butyrate kinase  48.17 
 
 
367 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0960  butyrate kinase  47.61 
 
 
367 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0659702 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4184  butyrate kinase  48.17 
 
 
367 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000389222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4294  butyrate kinase  48.17 
 
 
367 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4236  butyrate kinase  47.89 
 
 
367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4274  butyrate kinase  47.32 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2852  butyrate kinase  50 
 
 
361 aa  334  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2844  butyrate kinase  48.06 
 
 
358 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06760  butyrate kinase  46.05 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3544  butyrate kinase  45.22 
 
 
362 aa  325  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.505108  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0590  butyrate kinase  48.58 
 
 
361 aa  323  3e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1069  butyrate kinase  45.1 
 
 
375 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0107  butyrate kinase  45.94 
 
 
363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2106  butyrate kinase  51.16 
 
 
359 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1680  butyrate kinase  45.83 
 
 
358 aa  315  8e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00170652  normal  0.0185756 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0108  butyrate kinase  45.61 
 
 
361 aa  315  8e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.835306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2348  butyrate kinase  46.59 
 
 
352 aa  315  9e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311163  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2700  butyrate kinase  46.91 
 
 
352 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2358  butyrate kinase  47.32 
 
 
362 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0714814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0936  butyrate kinase  46.02 
 
 
353 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3152  butyrate kinase  42.98 
 
 
357 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1472  butyrate kinase  47.46 
 
 
355 aa  296  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1109  butyrate kinase  42.42 
 
 
361 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21870  butyrate kinase  45.35 
 
 
359 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1366  butyrate kinase  44.64 
 
 
370 aa  291  2e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0106  butyrate kinase  42.61 
 
 
357 aa  278  8e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1470  butyrate kinase  42.17 
 
 
362 aa  263  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0109  butyrate kinase  41.19 
 
 
356 aa  261  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0591  butyrate kinase  38.59 
 
 
362 aa  251  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0042  butyrate kinase  37.57 
 
 
368 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0058  butyrate kinase  37.57 
 
 
376 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.870551  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3128  butyrate kinase  36.44 
 
 
372 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0045  butyrate kinase  38.42 
 
 
366 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.90675 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1041  butyrate kinase  39.33 
 
 
357 aa  227  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.496289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1071  butyrate kinase  39.04 
 
 
357 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0046  butyrate kinase  37.01 
 
 
376 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2626  butyrate kinase  31.95 
 
 
453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2330  butyrate kinase  35.18 
 
 
372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0454  butyrate kinase  33.52 
 
 
359 aa  205  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1383  butyrate kinase  30.25 
 
 
356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000142085  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0258  Butyrate kinase  33.49 
 
 
333 aa  92  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  34.81 
 
 
422 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  32.34 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  32.42 
 
 
589 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  33.12 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  25.56 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0641  acetate kinase  30.86 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00773095  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  31.01 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  27.2 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  32.52 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1162  acetate kinase  27.51 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  25.28 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  27.53 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  28.75 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  25.28 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  33.33 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  30.63 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  31.06 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  31.9 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  31.03 
 
 
583 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  29.35 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  29.35 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  28.07 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  30.43 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  28.64 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  26.36 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  29.63 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  29.7 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  31.01 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  31.14 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  29.38 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  32.1 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  32.1 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  32.1 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  28.73 
 
 
404 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1272  acetate kinase  29.22 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0858677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  32.1 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  28.74 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  30.52 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  31.32 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  32.1 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  32.1 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  32.1 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  29.67 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  25.88 
 
 
772 aa  66.6  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  28.09 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  31.65 
 
 
394 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  32.1 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>