More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1109 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1109  butyrate kinase  100 
 
 
361 aa  721    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3152  butyrate kinase  93.22 
 
 
357 aa  658    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0939  butyrate kinase  48.01 
 
 
355 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2307  butyrate kinase  52.12 
 
 
370 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0107  butyrate kinase  52.38 
 
 
363 aa  369  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4236  butyrate kinase  50.85 
 
 
367 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4069  butyrate kinase  50.85 
 
 
367 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3907  butyrate kinase  50.85 
 
 
367 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3916  butyrate kinase  50.85 
 
 
367 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0615579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4184  butyrate kinase  50.85 
 
 
367 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000389222 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4386  butyrate kinase  50.85 
 
 
367 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2858  butyrate kinase  50.71 
 
 
367 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4294  butyrate kinase  50.85 
 
 
367 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4005  butyrate kinase  50.85 
 
 
367 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0960  butyrate kinase  51.27 
 
 
367 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0659702 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0263  butyrate kinase  53.09 
 
 
370 aa  364  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4274  butyrate kinase  50.71 
 
 
367 aa  362  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1069  butyrate kinase  50.28 
 
 
375 aa  362  4e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0108  butyrate kinase  49.44 
 
 
361 aa  357  9.999999999999999e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.835306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2128  butyrate kinase  47.22 
 
 
362 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06760  butyrate kinase  49.72 
 
 
356 aa  353  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2656  butyrate kinase  48.58 
 
 
356 aa  348  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2342  butyrate kinase  48.3 
 
 
356 aa  346  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1472  butyrate kinase  49.01 
 
 
355 aa  346  4e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1680  butyrate kinase  46.74 
 
 
358 aa  343  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00170652  normal  0.0185756 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2844  butyrate kinase  46.02 
 
 
358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2348  butyrate kinase  45.89 
 
 
352 aa  338  5.9999999999999996e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311163  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3544  butyrate kinase  48.73 
 
 
362 aa  338  7e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.505108  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0590  butyrate kinase  47.63 
 
 
361 aa  335  7e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2106  butyrate kinase  48.15 
 
 
359 aa  331  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2700  butyrate kinase  47.03 
 
 
352 aa  325  7e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2852  butyrate kinase  48.58 
 
 
361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2358  butyrate kinase  47.45 
 
 
362 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0714814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0106  butyrate kinase  42.62 
 
 
357 aa  310  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0109  butyrate kinase  42.62 
 
 
356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0936  butyrate kinase  43.79 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21870  butyrate kinase  42.7 
 
 
359 aa  301  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01633  butyrate kinase  42.42 
 
 
360 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3128  butyrate kinase  43.99 
 
 
372 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0591  butyrate kinase  42.58 
 
 
362 aa  286  5e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2626  butyrate kinase  40.05 
 
 
453 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1041  butyrate kinase  42.05 
 
 
357 aa  285  8e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.496289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1071  butyrate kinase  42.33 
 
 
357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1470  butyrate kinase  39.44 
 
 
362 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1366  butyrate kinase  42.11 
 
 
370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2330  butyrate kinase  44.01 
 
 
372 aa  269  7e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0042  butyrate kinase  44.38 
 
 
368 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0058  butyrate kinase  44.38 
 
 
376 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.870551  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0045  butyrate kinase  43.82 
 
 
366 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.90675 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0046  butyrate kinase  44.38 
 
 
376 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0454  butyrate kinase  38.84 
 
 
359 aa  233  6e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1383  butyrate kinase  37.28 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000142085  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0258  Butyrate kinase  34.91 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  33.01 
 
 
422 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  27.08 
 
 
404 aa  99.8  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  31.42 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  27.81 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  30.43 
 
 
401 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  33.53 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0720  acetate kinase  28.19 
 
 
452 aa  93.2  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0988409  hitchhiker  0.0000000373865 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  29.64 
 
 
398 aa  92.8  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  27.14 
 
 
397 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  34.18 
 
 
397 aa  90.1  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  35.4 
 
 
403 aa  89.7  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  35.4 
 
 
403 aa  89.7  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  26.9 
 
 
396 aa  89.4  9e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  32.73 
 
 
772 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  26.74 
 
 
394 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  30.25 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  28.27 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  27.46 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  29.6 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  29.6 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  26.88 
 
 
396 aa  87.4  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  25.22 
 
 
394 aa  87.4  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  29.2 
 
 
583 aa  86.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  33.52 
 
 
402 aa  86.3  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  34.3 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  28.85 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  32.79 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  32.91 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  39.38 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1162  acetate kinase  25.49 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  30.38 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0641  acetate kinase  25 
 
 
405 aa  84  0.000000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00773095  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  32.77 
 
 
398 aa  84  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  33.75 
 
 
406 aa  84  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  31.44 
 
 
402 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  29.7 
 
 
404 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  26.19 
 
 
399 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  29.48 
 
 
398 aa  82.8  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  31.69 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  26.37 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  33.87 
 
 
589 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  25 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1272  acetate kinase  31.19 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0858677  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  33.75 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  25 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  28.93 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  26.65 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>