More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2852 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2852  butyrate kinase  100 
 
 
361 aa  730    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0939  butyrate kinase  54.8 
 
 
355 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2858  butyrate kinase  53.52 
 
 
367 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0960  butyrate kinase  52.68 
 
 
367 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0659702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4236  butyrate kinase  52.11 
 
 
367 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4069  butyrate kinase  52.11 
 
 
367 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3907  butyrate kinase  52.11 
 
 
367 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3916  butyrate kinase  52.11 
 
 
367 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0615579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4386  butyrate kinase  52.11 
 
 
367 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2307  butyrate kinase  52.81 
 
 
370 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4005  butyrate kinase  52.11 
 
 
367 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4184  butyrate kinase  52.11 
 
 
367 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000389222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4294  butyrate kinase  52.39 
 
 
367 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4274  butyrate kinase  52.11 
 
 
367 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1069  butyrate kinase  52.11 
 
 
375 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0107  butyrate kinase  52.68 
 
 
363 aa  371  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215976  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0590  butyrate kinase  54.08 
 
 
361 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2656  butyrate kinase  51.27 
 
 
356 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2342  butyrate kinase  50.99 
 
 
356 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0263  butyrate kinase  55.34 
 
 
370 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1680  butyrate kinase  51.54 
 
 
358 aa  363  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00170652  normal  0.0185756 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0108  butyrate kinase  52.41 
 
 
361 aa  363  2e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.835306  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0109  butyrate kinase  50.42 
 
 
356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2358  butyrate kinase  53.24 
 
 
362 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0714814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1472  butyrate kinase  51.13 
 
 
355 aa  350  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2348  butyrate kinase  47.86 
 
 
352 aa  344  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311163  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0936  butyrate kinase  48.3 
 
 
353 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2700  butyrate kinase  49.29 
 
 
352 aa  335  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01633  butyrate kinase  50 
 
 
360 aa  334  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06760  butyrate kinase  49 
 
 
356 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0106  butyrate kinase  47.58 
 
 
357 aa  333  4e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3544  butyrate kinase  47.61 
 
 
362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.505108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2128  butyrate kinase  46.88 
 
 
362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3152  butyrate kinase  49.43 
 
 
357 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1109  butyrate kinase  48.58 
 
 
361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0591  butyrate kinase  45.76 
 
 
362 aa  310  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0045  butyrate kinase  50.42 
 
 
366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.90675 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2844  butyrate kinase  46.18 
 
 
358 aa  306  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21870  butyrate kinase  44.76 
 
 
359 aa  306  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1470  butyrate kinase  44.09 
 
 
362 aa  302  5.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2106  butyrate kinase  48.3 
 
 
359 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1366  butyrate kinase  44.64 
 
 
370 aa  294  2e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1041  butyrate kinase  43.02 
 
 
357 aa  290  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.496289  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0042  butyrate kinase  47.16 
 
 
368 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0058  butyrate kinase  47.16 
 
 
376 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.870551  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1071  butyrate kinase  42.46 
 
 
357 aa  287  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0046  butyrate kinase  46.88 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2330  butyrate kinase  45.13 
 
 
372 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3128  butyrate kinase  43.68 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2626  butyrate kinase  39.22 
 
 
453 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0454  butyrate kinase  40.29 
 
 
359 aa  224  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1383  butyrate kinase  36.44 
 
 
356 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000142085  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0258  Butyrate kinase  33.69 
 
 
333 aa  113  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  35.12 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  26.91 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  35.62 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  33.54 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  36.6 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  35 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  31.76 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  29.05 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  32.35 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  26.84 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  31.43 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  29.89 
 
 
406 aa  67  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  32.93 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  34.34 
 
 
589 aa  66.6  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  32.68 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  26.16 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  25.87 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  26.16 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  26.16 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  25.87 
 
 
397 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  25.87 
 
 
397 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  25.87 
 
 
397 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2686  acetate kinase  29.65 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.888015 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2478  acetate kinase  29.65 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679526  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2523  acetate kinase  29.65 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.340235 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2566  acetate kinase  29.65 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  26.9 
 
 
398 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2578  acetate kinase  29.65 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02221  acetate kinase  31.55 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.177023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2590  acetate kinase  31.55 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0300293  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1360  acetate kinase  31.55 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2672  acetate kinase  31.55 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.733134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  25.87 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  25.87 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1356  acetate kinase  31.55 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.446941  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  25.87 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2840  acetate kinase  30.36 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  30.63 
 
 
404 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  28.44 
 
 
583 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3436  acetate kinase  31.55 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1925  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02181  hypothetical protein  31.55 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154164  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  30.52 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  35.4 
 
 
402 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  34.71 
 
 
399 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2452  acetate kinase  31.55 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2446  acetate kinase  31.55 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0138092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  27.07 
 
 
402 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>