264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3128 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3128  butyrate kinase  100 
 
 
372 aa  743    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2626  butyrate kinase  52.44 
 
 
453 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2330  butyrate kinase  59.89 
 
 
372 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0939  butyrate kinase  46.59 
 
 
355 aa  349  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06760  butyrate kinase  45.9 
 
 
356 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2307  butyrate kinase  45.78 
 
 
370 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0108  butyrate kinase  44.66 
 
 
361 aa  314  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.835306  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0107  butyrate kinase  42.93 
 
 
363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215976  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0590  butyrate kinase  45.9 
 
 
361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0263  butyrate kinase  46.45 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1069  butyrate kinase  42.93 
 
 
375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1680  butyrate kinase  42.03 
 
 
358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00170652  normal  0.0185756 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2858  butyrate kinase  43.13 
 
 
367 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4294  butyrate kinase  43.96 
 
 
367 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4236  butyrate kinase  43.9 
 
 
367 aa  299  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0960  butyrate kinase  44.23 
 
 
367 aa  299  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0659702 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4184  butyrate kinase  43.41 
 
 
367 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000389222 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4069  butyrate kinase  43.41 
 
 
367 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3907  butyrate kinase  43.41 
 
 
367 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3916  butyrate kinase  43.41 
 
 
367 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0615579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4386  butyrate kinase  43.41 
 
 
367 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4005  butyrate kinase  43.41 
 
 
367 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1109  butyrate kinase  43.99 
 
 
361 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2656  butyrate kinase  42.31 
 
 
356 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4274  butyrate kinase  43.68 
 
 
367 aa  295  7e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2342  butyrate kinase  42.03 
 
 
356 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3152  butyrate kinase  44.02 
 
 
357 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1472  butyrate kinase  40.76 
 
 
355 aa  280  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2348  butyrate kinase  40.66 
 
 
352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311163  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3544  butyrate kinase  40.27 
 
 
362 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.505108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0936  butyrate kinase  40.11 
 
 
353 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0109  butyrate kinase  39.89 
 
 
356 aa  271  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2700  butyrate kinase  42.03 
 
 
352 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2128  butyrate kinase  37.64 
 
 
362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2852  butyrate kinase  43.68 
 
 
361 aa  269  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21870  butyrate kinase  40.66 
 
 
359 aa  262  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2358  butyrate kinase  44.38 
 
 
362 aa  256  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0714814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2844  butyrate kinase  36.81 
 
 
358 aa  252  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1470  butyrate kinase  36.93 
 
 
362 aa  252  9.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0106  butyrate kinase  36.44 
 
 
357 aa  249  5e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01633  butyrate kinase  36.44 
 
 
360 aa  249  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1041  butyrate kinase  37.63 
 
 
357 aa  246  6e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.496289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2106  butyrate kinase  39.01 
 
 
359 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1071  butyrate kinase  37.63 
 
 
357 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0045  butyrate kinase  45.08 
 
 
366 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.90675 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0591  butyrate kinase  36.71 
 
 
362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0058  butyrate kinase  42.74 
 
 
376 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.870551  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1366  butyrate kinase  35.94 
 
 
370 aa  229  5e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0454  butyrate kinase  39.07 
 
 
359 aa  224  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0042  butyrate kinase  41.92 
 
 
368 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0046  butyrate kinase  43.21 
 
 
376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1383  butyrate kinase  36.07 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000142085  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0258  Butyrate kinase  31.65 
 
 
333 aa  87  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  34.36 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  30.15 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  32.88 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  26.88 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  30.53 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1162  acetate kinase  28.96 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  29.1 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  29.1 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  23.58 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  26.34 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  27.42 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  29.26 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  27.13 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  27.93 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  29.11 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2998  acetate kinase  27.69 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  23.25 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  27.51 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  26.61 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  26.06 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  26.17 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  30 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  30 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3044  acetate kinase  32.8 
 
 
386 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  26.06 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  28.29 
 
 
583 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  25 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  28.95 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1272  acetate kinase  32.8 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0858677  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3238  acetate kinase  32.26 
 
 
386 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  23.22 
 
 
398 aa  63.5  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  30.61 
 
 
399 aa  63.2  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  28.19 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3562  propionate/acetate kinase  26.94 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  23.63 
 
 
404 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4397  acetate kinase  29.34 
 
 
398 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  30.86 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  30.64 
 
 
421 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  25.26 
 
 
406 aa  61.2  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  26.19 
 
 
412 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  22.28 
 
 
394 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  25.53 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  27.57 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  23.89 
 
 
399 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01770  acetate kinase  32.26 
 
 
388 aa  60.1  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  24.74 
 
 
406 aa  59.7  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  26.46 
 
 
397 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>