More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1780 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  100 
 
 
314 aa  634  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  74.67 
 
 
314 aa  468  1e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  65.27 
 
 
311 aa  399  1e-110  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.78146e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  61.54 
 
 
310 aa  371  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  61.29 
 
 
310 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  59.4 
 
 
311 aa  331  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.86478e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  57.19 
 
 
313 aa  316  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3371  glutamate--tRNA ligase  54.3 
 
 
309 aa  314  2e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 
301 aa  292  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.48 
 
 
299 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3769  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.16 
 
 
301 aa  288  9e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0219396 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  52.5 
 
 
283 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0676  glutamate--tRNA ligase  50.34 
 
 
310 aa  266  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3639  Glutamate--tRNA ligase  55.59 
 
 
318 aa  266  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0797  glutamate--tRNA ligase  45.07 
 
 
303 aa  251  8e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.76322e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3586  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.83 
 
 
294 aa  249  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2315  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.01 
 
 
298 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0962  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.51 
 
 
298 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294785  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1703  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.01 
 
 
298 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1882  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  47.95 
 
 
295 aa  246  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2234  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.46 
 
 
294 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62510  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.46 
 
 
293 aa  243  2e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.632499  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5657  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.28 
 
 
297 aa  242  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2338  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.21 
 
 
298 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2081  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  49.64 
 
 
294 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178855  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  52.21 
 
 
292 aa  239  3e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2581  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.85 
 
 
310 aa  239  3e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0900  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.24 
 
 
301 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5440  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.78 
 
 
293 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0922  glutamate--tRNA ligase  46.34 
 
 
300 aa  236  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1251  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  50.82 
 
 
296 aa  234  1e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42650  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.76 
 
 
298 aa  234  1e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.404894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.36 
 
 
297 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1915  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.36 
 
 
297 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00194048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1041  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.36 
 
 
297 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.512398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0324  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.36 
 
 
297 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171328  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1203  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.36 
 
 
297 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1195  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.36 
 
 
297 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0519068  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0827  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.36 
 
 
297 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4805  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.1 
 
 
298 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167775  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3032  glutamate--tRNA ligase  48.15 
 
 
335 aa  232  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490403  normal  0.333291 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0982  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.52 
 
 
297 aa  232  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0779  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  44.03 
 
 
290 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00289158  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  50.41 
 
 
296 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0605  glutamate--tRNA ligase  48.64 
 
 
316 aa  228  8e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3061  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.67 
 
 
291 aa  228  8e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.293014  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2934  glutamate--tRNA ligase  43.2 
 
 
327 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0900886  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2354  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.28 
 
 
297 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0532352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3799  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  43.58 
 
 
299 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.13424e-06  hitchhiker  2.43395e-05 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002564  glutamyl-Q-tRNA synthetase  43.73 
 
 
287 aa  225  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  5.02231e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2014  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  49.4 
 
 
311 aa  225  9e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2408  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.63 
 
 
314 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0690  glutamate--tRNA ligase  49.41 
 
 
300 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.858834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4558  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.98 
 
 
300 aa  223  5e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.48174e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0201  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.57 
 
 
313 aa  221  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000353889  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0202  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.57 
 
 
313 aa  221  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0366994  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4692  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.95 
 
 
295 aa  221  1e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  6.87127e-06 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0213  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.57 
 
 
313 aa  221  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0227861  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0873  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  44.56 
 
 
299 aa  221  1e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2210  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.59 
 
 
315 aa  220  2e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.895513  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4694  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.58 
 
 
300 aa  220  2e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0684  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.66 
 
 
296 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000131697  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0967  glutamyl-tRNA synthetase-related protein  45.08 
 
 
295 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1163  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.22 
 
 
322 aa  219  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0217  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.23 
 
 
313 aa  219  4e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127053  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0848  glutamate--tRNA ligase  41.08 
 
 
304 aa  219  4e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.66391e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0219  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.23 
 
 
313 aa  219  4e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  4.98005e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0834  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.3 
 
 
295 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0729  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  42.21 
 
 
299 aa  218  9e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.94668e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3900  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.24 
 
 
305 aa  218  9e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.43108e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3293  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  42.21 
 
 
299 aa  218  9e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.89418e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2749  Glutamate--tRNA ligase  46.93 
 
 
306 aa  218  9e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242915  normal  0.441865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3126  Glutamate--tRNA ligase  47.86 
 
 
307 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4049  glutamate--tRNA ligase  48.05 
 
 
312 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963278  normal  0.0953958 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3115  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.07 
 
 
352 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000632224  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1031  Glutamate--tRNA ligase  41.58 
 
 
302 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.011538  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0583  glutamate--tRNA ligase  39.19 
 
 
308 aa  218  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0883  glutamate--tRNA ligase  42.05 
 
 
304 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  3.49981e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0126  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.4 
 
 
296 aa  216  3e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  3.6555e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  46.44 
 
 
302 aa  216  3e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3986  glutamate--tRNA ligase  41.86 
 
 
303 aa  217  3e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000239485  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0518  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  44.37 
 
 
302 aa  216  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3405  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  42.24 
 
 
299 aa  216  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  3.37292e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  45.02 
 
 
311 aa  216  6e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  2.57577e-07  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0155  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.88 
 
 
308 aa  215  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  3.30797e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.83 
 
 
313 aa  215  1e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3458  Glutamate--tRNA ligase  40.33 
 
 
308 aa  214  1e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.33336e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0147  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.33 
 
 
308 aa  214  1e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.35998e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3491  glutamate--tRNA ligase  42.38 
 
 
304 aa  214  1e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  5.45607e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
318 aa  214  1e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 
317 aa  214  1e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3130  glutamate--tRNA ligase  42.95 
 
 
319 aa  214  1e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.03356e-07  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3129  glutamate--tRNA ligase  40.74 
 
 
299 aa  214  2e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  9.21619e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0871  Glutamate--tRNA ligase  40.13 
 
 
304 aa  214  2e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.93825e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.33 
 
 
308 aa  214  2e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  9.52983e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00142  hypothetical protein  40.54 
 
 
308 aa  213  3e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  7.3692e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0148  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40 
 
 
308 aa  213  3e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  1.29858e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0697  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  42.38 
 
 
292 aa  213  3e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.8618e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00143  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.54 
 
 
308 aa  213  3e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  9.65107e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0153  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.54 
 
 
308 aa  213  3e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  2.16792e-06  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>