More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1388 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1388  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  100 
 
 
322 aa  646    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47229  normal  0.722394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1487  riboflavin biosynthesis protein RibF  71.03 
 
 
322 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.038683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2686  riboflavin biosynthesis protein RibF  66.88 
 
 
320 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000517202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2599  riboflavin biosynthesis protein RibF  61.56 
 
 
323 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1627  riboflavin biosynthesis protein RibF  61.89 
 
 
323 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2151  riboflavin biosynthesis protein RibF  54.35 
 
 
330 aa  358  5e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3182  riboflavin biosynthesis protein RibF  48.38 
 
 
312 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.260327  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2517  riboflavin biosynthesis protein RibF  48.7 
 
 
325 aa  296  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.24857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1649  riboflavin biosynthesis protein RibF  50.34 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3505  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  47.88 
 
 
314 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1762  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.93 
 
 
314 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.95 
 
 
313 aa  264  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2972  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.79 
 
 
314 aa  258  7e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1312  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.12 
 
 
312 aa  246  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2486  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.65 
 
 
314 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2234  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.87 
 
 
317 aa  238  9e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1375  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.56 
 
 
308 aa  236  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04030  Riboflavin kinase / FAD synthetase  41.9 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0364  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.26 
 
 
313 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000221325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0641  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.13 
 
 
312 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1082  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.22 
 
 
311 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0790  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.26 
 
 
309 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.604563 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0923  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.03 
 
 
311 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3549  riboflavin biosynthesis protein RibF  39 
 
 
311 aa  226  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0799  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.46 
 
 
310 aa  224  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1193  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.22 
 
 
311 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000237633  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1658  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.04 
 
 
319 aa  222  8e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1290  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.89 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000080021  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1181  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.39 
 
 
306 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0213  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.92 
 
 
322 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1641  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.79 
 
 
316 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1782  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.72 
 
 
312 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0330041  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.91 
 
 
311 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1953  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.93 
 
 
311 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00979  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.25 
 
 
311 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03031  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.24 
 
 
289 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0128028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3672  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.74 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000331825  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1776  riboflavin kinase / FAD synthetase  39.13 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.143306  normal  0.170251 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0930  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.69 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0321744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3856  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.66 
 
 
323 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3847  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.66 
 
 
323 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0987  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  38.41 
 
 
312 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3236  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.45 
 
 
311 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.440094  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1120  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.45 
 
 
311 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1187  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.93 
 
 
309 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3533  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.6 
 
 
311 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3047  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  41.45 
 
 
306 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0533296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1058  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.93 
 
 
311 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2724  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.94 
 
 
311 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103356  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0200  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.83 
 
 
313 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1247  riboflavin biosynthesis protein RibF  39 
 
 
308 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3660  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.34 
 
 
323 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00940853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3550  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.34 
 
 
323 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3568  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.34 
 
 
323 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000147848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3946  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.34 
 
 
323 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2958  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  36.6 
 
 
311 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229832  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3040  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  36.6 
 
 
311 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00882094  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3820  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.34 
 
 
323 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3137  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  36.6 
 
 
311 aa  210  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00248689  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1053  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.13 
 
 
311 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1155  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.13 
 
 
311 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00349764  normal  0.220193 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3662  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.74 
 
 
309 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004420  riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.64 
 
 
294 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0885612  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0947  bifunctional protein: riboflavin kinase; FAD synthetase  39.74 
 
 
309 aa  209  5e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6523  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.74 
 
 
311 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2209  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  38.51 
 
 
306 aa  209  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1127  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.04 
 
 
311 aa  208  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0405  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.12 
 
 
321 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0771375  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1337  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.83 
 
 
323 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.536973  hitchhiker  0.00905028 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3030  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.2 
 
 
329 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2891  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.74 
 
 
311 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3187  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.35 
 
 
310 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0757172  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3272  bifunctional riboflavin kinase and FMN adenylyltransferase  35.86 
 
 
310 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3907  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.83 
 
 
323 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0245  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.62 
 
 
314 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.694964  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2965  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  37.74 
 
 
317 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0760879  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1843  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.6 
 
 
316 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18679  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0577  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.38 
 
 
305 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3756  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.16 
 
 
310 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000159125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2437  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.29 
 
 
325 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_002936  DET0602  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.01 
 
 
305 aa  206  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00769126  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1327  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.81 
 
 
326 aa  205  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.586967  normal  0.980544 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0579  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.69 
 
 
310 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0112657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07880  FMN adenylyltransferase;riboflavin kinase  37.37 
 
 
307 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23420  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  36.71 
 
 
329 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.119836 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07060  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  38.99 
 
 
325 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_542  FAD synthase  38.36 
 
 
305 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0794866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3589  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.29 
 
 
312 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000042831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3179  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.74 
 
 
308 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0709  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.3 
 
 
314 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0697  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.27 
 
 
312 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000218333  normal  0.0345347 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2653  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.79 
 
 
335 aa  203  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0547  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.81 
 
 
313 aa  202  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0791  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.96 
 
 
312 aa  203  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000794862  normal  0.660048 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3461  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.96 
 
 
312 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000511039  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2252  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.3 
 
 
309 aa  202  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0853928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3184  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.22 
 
 
311 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.516481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2927  riboflavin biosynthesis protein  38.06 
 
 
317 aa  202  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0456269 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0188  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  34.41 
 
 
314 aa  202  9e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1856  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  38.14 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>