More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0577 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0577  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  100 
 
 
305 aa  622  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0602  riboflavin biosynthesis protein RibF  90.82 
 
 
305 aa  554  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00769126  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_542  FAD synthase  90.49 
 
 
305 aa  555  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0794866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1312  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.81 
 
 
312 aa  230  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1487  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.18 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.038683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1388  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.38 
 
 
322 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47229  normal  0.722394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1054  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  41.32 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000197835  hitchhiker  0.0000124783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0245  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.52 
 
 
314 aa  212  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.694964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1127  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.79 
 
 
311 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2972  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.16 
 
 
314 aa  209  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2686  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.38 
 
 
320 aa  208  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000517202  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0364  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.57 
 
 
313 aa  208  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000221325  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.44 
 
 
313 aa  207  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1641  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.37 
 
 
316 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2051  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.59 
 
 
328 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3756  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.97 
 
 
310 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000159125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2599  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.93 
 
 
323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0907  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.62 
 
 
324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0998  riboflavin biosynthesis protein RibF (riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase)  39.74 
 
 
328 aa  199  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3769  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.84 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2035  FMN adenylyltransferase, riboflavin kinase  39.6 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1375  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.52 
 
 
308 aa  197  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1762  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.52 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2151  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.1 
 
 
330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0503  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.86 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0967  riboflavin biosynthesis protein RibF (riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase)  38.76 
 
 
328 aa  195  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1627  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.79 
 
 
323 aa  195  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1675  FMN adenylyltransferase  39.51 
 
 
345 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2304  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  39.2 
 
 
306 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1953  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.14 
 
 
311 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3182  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.58 
 
 
312 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.260327  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0979  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.2 
 
 
306 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14650  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  37.54 
 
 
313 aa  193  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0844225  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3215  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.09 
 
 
308 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07880  FMN adenylyltransferase;riboflavin kinase  37.07 
 
 
307 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0613  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.6 
 
 
319 aa  192  5e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.386069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3505  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.52 
 
 
314 aa  192  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1337  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.04 
 
 
309 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107929  hitchhiker  0.00108968 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1290  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.28 
 
 
311 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000080021  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1448  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.38 
 
 
316 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000276726  normal  0.276932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0714  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.41 
 
 
369 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04030  Riboflavin kinase / FAD synthetase  35.94 
 
 
307 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5827  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.1 
 
 
310 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5114  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.57 
 
 
314 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2195  normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1843  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.45 
 
 
316 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18679  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1379  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.36 
 
 
309 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.672568  normal  0.471041 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1159  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.29 
 
 
327 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287136  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1430  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  36.16 
 
 
327 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0904  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.41 
 
 
319 aa  189  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1273  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.33 
 
 
296 aa  188  1e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.609723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2214  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.43 
 
 
313 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00156337  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0799  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.19 
 
 
310 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2252  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.15 
 
 
309 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0853928  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2486  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.07 
 
 
314 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004420  riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.8 
 
 
294 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0885612  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1193  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.59 
 
 
311 aa  185  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000237633  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2770  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.99 
 
 
317 aa  185  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2196  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.87 
 
 
306 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0759  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.13 
 
 
310 aa  185  9e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.776079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4028  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.72 
 
 
338 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2161  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.21 
 
 
323 aa  185  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0689935  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3326  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.5 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0873807  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2234  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.62 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1435  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.83 
 
 
327 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.2 
 
 
311 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2384  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.01 
 
 
311 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0303  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.86 
 
 
321 aa  183  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2517  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.62 
 
 
325 aa  183  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.24857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3672  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.9 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000331825  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0492  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.1 
 
 
315 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.196365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0213  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.77 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1649  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.36 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1809  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.58 
 
 
303 aa  182  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3956  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.44 
 
 
324 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3533  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.16 
 
 
311 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1412  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.18 
 
 
315 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0461  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.4 
 
 
311 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.890869  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0579  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.59 
 
 
310 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0112657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1082  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.21 
 
 
311 aa  180  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1053  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.5 
 
 
311 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1187  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.36 
 
 
309 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1155  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.5 
 
 
311 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00349764  normal  0.220193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00979  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.77 
 
 
311 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0886  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.91 
 
 
328 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6523  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.47 
 
 
311 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0923  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.11 
 
 
311 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0957  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.01 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0600204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1181  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.36 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1776  riboflavin kinase / FAD synthetase  37.19 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.143306  normal  0.170251 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0641  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.33 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.967274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3184  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.02 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.516481 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0188  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.39 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0987  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  34.13 
 
 
312 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1058  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.82 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3260  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  35.49 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.853112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2437  riboflavin biosynthesis protein RibF  38 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1055  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.6 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000443008  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0200  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.03 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3907  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.62 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0930  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.9 
 
 
308 aa  178  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0321744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>