38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3298 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 602 aa  1158    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  34.05 
 
 		 630 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  30.13 
 
 		 423 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  36.3 
 
 		 926 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0415  multiple banded antigen  25.56 
 
 		 423 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3432  flagellar hook-length control protein  39.49 
 
 		 570 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4207  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 604 aa  93.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  28.33 
 
 		 489 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  26.44 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  29.73 
 
 		 660 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  29.73 
 
 		 656 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3106  flagellar hook-length control protein  35.34 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0760  hypothetical protein  21.59 
 
 		 433 aa  76.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152814  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  29.92 
 
 		 1240 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0416  hypothetical protein  42.68 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0549  hypothetical protein  37.5 
 
 		 501 aa  67.4  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  23.49 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5798  serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 		 565 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.56 
 
 		 491 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4086  putative granule-associated protein  39.23 
 
 		 287 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00010965  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  55.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4832  FtsK/SpoIIIE family protein  45.7 
 
 		 1266 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0790517  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  44.2 
 
 		 784 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4161  spoVID-dependent spore coat assembly factor SafA; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein PspC  37.63 
 
 		 609 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  22.67 
 
 		 928 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  38.89 
 
 		 522 aa  50.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4172  spoVID-dependent spore coat assembly factor; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein  36.56 
 
 		 621 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  20.25 
 
 		 3521 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  25.82 
 
 		 941 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4512  lysM domain-containing protein  27.39 
 
 		 608 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6891  hypothetical protein  28.9 
 
 		 263 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 332 aa  47.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0454  hypothetical protein  23.68 
 
 		 744 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1261 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4585  FtsK/SpoIIIE family protein  42.86 
 
 		 1311 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4940  FtsK/SpoIIIE family protein  42.86 
 
 		 1311 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3583  flagellar hook-length control protein  31.73 
 
 		 334 aa  44.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  35 
 
 		 394 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>