More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2702 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  80.09 
 
 
467 aa  786    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
475 aa  982    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  79.24 
 
 
477 aa  798    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  71.12 
 
 
468 aa  693    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  80.3 
 
 
466 aa  793    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  79.11 
 
 
477 aa  798    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  83.76 
 
 
474 aa  826    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  79.15 
 
 
474 aa  796    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  60.78 
 
 
476 aa  578  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  61.13 
 
 
485 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  60.92 
 
 
485 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  61.86 
 
 
484 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  60.71 
 
 
485 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  60.44 
 
 
482 aa  569  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  59.87 
 
 
475 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  59.87 
 
 
481 aa  549  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  58.71 
 
 
511 aa  539  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  57.33 
 
 
503 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  54.53 
 
 
461 aa  534  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  56.4 
 
 
517 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  56.57 
 
 
471 aa  528  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  56.35 
 
 
471 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  56.12 
 
 
471 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  56.12 
 
 
471 aa  525  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  56.12 
 
 
471 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  56.12 
 
 
471 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  54.77 
 
 
488 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  56.12 
 
 
471 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  55.63 
 
 
502 aa  526  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  56.42 
 
 
487 aa  528  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  56.12 
 
 
471 aa  524  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  55.26 
 
 
451 aa  525  1e-147  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  56.12 
 
 
471 aa  523  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  57.99 
 
 
466 aa  524  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  56.12 
 
 
471 aa  524  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  54.08 
 
 
514 aa  525  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  55.02 
 
 
488 aa  521  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  55.46 
 
 
471 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  54.92 
 
 
493 aa  519  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  55.19 
 
 
486 aa  521  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  54.53 
 
 
490 aa  520  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  54.32 
 
 
463 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
495 aa  512  1e-144  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  52.67 
 
 
508 aa  513  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
469 aa  514  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  55.63 
 
 
501 aa  514  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  54.08 
 
 
491 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  53.17 
 
 
497 aa  512  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  55.11 
 
 
514 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  53.42 
 
 
491 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  55.09 
 
 
470 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  55.58 
 
 
474 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  54 
 
 
500 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  53.78 
 
 
499 aa  512  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  54.59 
 
 
462 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  56.29 
 
 
491 aa  508  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  53.1 
 
 
500 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  54.16 
 
 
462 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  53.61 
 
 
470 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  54.08 
 
 
509 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  54.67 
 
 
503 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  53.41 
 
 
478 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  54.75 
 
 
496 aa  501  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  52.06 
 
 
487 aa  498  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  54.19 
 
 
480 aa  501  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  52.76 
 
 
480 aa  500  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  53.48 
 
 
499 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  53.64 
 
 
510 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
487 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
487 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
467 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
474 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
506 aa  497  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
486 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  53.19 
 
 
472 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  54.23 
 
 
465 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  53.19 
 
 
475 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  52.84 
 
 
506 aa  490  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  53.9 
 
 
478 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  54.67 
 
 
514 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  53.67 
 
 
502 aa  486  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0122  amidophosphoribosyltransferase  54.63 
 
 
467 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  51.67 
 
 
479 aa  485  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  51.11 
 
 
503 aa  486  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  52.1 
 
 
472 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  52.45 
 
 
504 aa  484  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  51.81 
 
 
504 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0163  amidophosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
526 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124827  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  52.19 
 
 
496 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  52.4 
 
 
496 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  52.4 
 
 
529 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0174  amidophosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
445 aa  479  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.838457  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  51.01 
 
 
446 aa  479  1e-134  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  52.85 
 
 
496 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
472 aa  476  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
484 aa  478  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  51.1 
 
 
493 aa  477  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  50.99 
 
 
496 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>