26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2348 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2348  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  25.34 
 
 
280 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
296 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  21.56 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  32.56 
 
 
1124 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
242 aa  52.8  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  31.4 
 
 
311 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
358 aa  51.2  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  31.75 
 
 
240 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  30.26 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  26.53 
 
 
239 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  32.53 
 
 
181 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.26 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  27 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  37.88 
 
 
254 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
507 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  22.7 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  22.67 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  23.4 
 
 
415 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  23.24 
 
 
222 aa  42.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  28.77 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  27.27 
 
 
870 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>