69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0741 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0741  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  954    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.849095  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  26.25 
 
 		 375 aa  99.8  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.55 
 
 		 376 aa  95.9  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  27.63 
 
 		 379 aa  94.4  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  27.71 
 
 		 384 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  27.71 
 
 		 384 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  27.71 
 
 		 384 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  27.71 
 
 		 384 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  27.71 
 
 		 384 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  27.31 
 
 		 384 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  27.31 
 
 		 384 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.86 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.33 
 
 		 374 aa  93.2  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.4 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.33 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.67 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.4 
 
 		 384 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.8 
 
 		 384 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.4 
 
 		 384 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  27.35 
 
 		 384 aa  90.1  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  25 
 
 		 384 aa  90.1  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1240  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.69 
 
 		 379 aa  90.1  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.398831  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  27.76 
 
 		 384 aa  90.1  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.2 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.5 
 
 		 375 aa  89.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.14 
 
 		 379 aa  89.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.31 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.31 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.76 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.83 
 
 		 375 aa  87.8  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.82 
 
 		 383 aa  87  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  26.23 
 
 		 380 aa  87  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.1 
 
 		 382 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.08 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  27.87 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.3 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.36 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.79 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  28.28 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000314112  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.25 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.51 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.74 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1978  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.2 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.16 
 
 		 375 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.87 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.34 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.67 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.08 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.67 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  26.25 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.67 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.85 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.75 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.82 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.25 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  23.85 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.17 
 
 		 375 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.71 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  25.41 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.16 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  26.64 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.43 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.97 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  24.39 
 
 		 375 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  23.32 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.53 
 
 		 383 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  23.89 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.38 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.45 
 
 		 393 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>