More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3924 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3924  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
317 aa  624  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6819  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.52 
 
 
304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3541  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.01 
 
 
304 aa  291  8e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5090  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.49 
 
 
300 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4900  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.82 
 
 
300 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79916  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4517  phosphate ABC transporter permease  53.82 
 
 
300 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.82 
 
 
300 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1663  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.9 
 
 
300 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481341  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0873  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.31 
 
 
303 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.501959  normal  0.143992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  48.04 
 
 
297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10948  phosphate-transport system integral membrane ABC transporter pstA1  49.33 
 
 
304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0591  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.32 
 
 
299 aa  252  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  47.87 
 
 
291 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.7 
 
 
309 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.83 
 
 
359 aa  235  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2742  phosphate ABC transporter permease  45.92 
 
 
361 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00664487  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37640  phosphate ABC transporter membrane protein  47.35 
 
 
364 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31850  phosphate ABC transporter membrane protein  46.57 
 
 
365 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2962  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.89 
 
 
322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4650  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.74 
 
 
362 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0354  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.46 
 
 
354 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0932568  normal  0.0141277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06960  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  44.1 
 
 
383 aa  223  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0660  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.14 
 
 
354 aa  223  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330308 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2080  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.32 
 
 
357 aa  223  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4263  phosphate ABC transporter permease  47.95 
 
 
354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.92 
 
 
358 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.88 
 
 
694 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0364  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.48 
 
 
370 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2966  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.34 
 
 
317 aa  207  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01630  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  45 
 
 
367 aa  207  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4979  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.37 
 
 
359 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0204  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.12 
 
 
369 aa  205  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25600  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  40.13 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0714898  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  44.71 
 
 
291 aa  195  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0223  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  40.8 
 
 
345 aa  192  5e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1070  phosphate ABC transporter permease  46.59 
 
 
332 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2215  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  41.11 
 
 
306 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.136565 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.42 
 
 
298 aa  179  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40 
 
 
281 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2268  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.26 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1268  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.79 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7662  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.24 
 
 
412 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2856  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.57 
 
 
298 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2254  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.11 
 
 
286 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3271  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.8 
 
 
301 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176924  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2685  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.8 
 
 
301 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206864  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0884  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.83 
 
 
298 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0561416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4916  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.57 
 
 
294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.348017 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2221  phosphate ABC transporter permease  41.53 
 
 
304 aa  155  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.155385 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2771  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.29 
 
 
297 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47464  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1928  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstA  39.77 
 
 
304 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0575886  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1620  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.43 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0576  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.43 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1517  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.43 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1293  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.43 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0575  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.43 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1487  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.43 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5387  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.04 
 
 
303 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2628  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.92 
 
 
294 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1274  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.36 
 
 
294 aa  152  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4169  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.13 
 
 
295 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1516  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.59 
 
 
280 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.313214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.59 
 
 
280 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001094  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4233  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.42 
 
 
295 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4195  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.42 
 
 
295 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.412756  normal  0.0222213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.02 
 
 
295 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271806  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03610  phosphate transporter subunit  42.33 
 
 
296 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4202  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.33 
 
 
296 aa  150  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4186  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.33 
 
 
296 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4237  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.33 
 
 
296 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5155  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.33 
 
 
296 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.546708 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03554  hypothetical protein  42.33 
 
 
296 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4139  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.33 
 
 
296 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4090  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.33 
 
 
296 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3941  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.33 
 
 
296 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1179  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.64 
 
 
297 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4064  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.33 
 
 
296 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.517165  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4268  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.33 
 
 
296 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4136  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.33 
 
 
296 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4080  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.33 
 
 
296 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1348  ABC transporter phosphate permease  39.11 
 
 
287 aa  149  5e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.607986  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4243  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.33 
 
 
296 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1284  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.11 
 
 
287 aa  149  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2812  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.47 
 
 
288 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4241  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.33 
 
 
296 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2370  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.77 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1309  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.4 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2204  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.25 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1291  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.45 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1488  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.69 
 
 
293 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1191  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.19 
 
 
297 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403091  normal  0.235503 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4265  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.87 
 
 
295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0014  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.81 
 
 
293 aa  145  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252026  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0456  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.62 
 
 
444 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2018  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.78 
 
 
297 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4586  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.87 
 
 
295 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00541  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  37.19 
 
 
289 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.175645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0916  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.43 
 
 
396 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4445  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.74 
 
 
297 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2703  phosphate ABC transporter permease  36.84 
 
 
279 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>