More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1714 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1714  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
243 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  57.01 
 
 
210 aa  188  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1176  peptidase M22, glycoprotease  55.19 
 
 
211 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0451061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1149  peptidase M22, glycoprotease  55.19 
 
 
211 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1166  peptidase M22, glycoprotease  55.19 
 
 
211 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.533647 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4931  peptidase M22, glycoprotease  55.81 
 
 
210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0883  peptidase M22 glycoprotease  50.23 
 
 
191 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0111529  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13455  hypothetical protein  52.61 
 
 
215 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00396413  hitchhiker  0.000602893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04630  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  48.87 
 
 
207 aa  165  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47382  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0627  peptidase M22, glycoprotease  49.75 
 
 
254 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4457  peptidase M22 glycoprotease  47.69 
 
 
212 aa  155  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6007  peptidase M22 glycoprotease  42.8 
 
 
287 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.463097  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6548  peptidase M22 glycoprotease  48.42 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  45.75 
 
 
231 aa  141  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  43.89 
 
 
225 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  46.86 
 
 
248 aa  141  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0562  peptidase M22 glycoprotease  45.75 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.849533  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  42.54 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4243  peptidase M22 glycoprotease  47.37 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0145677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0614  peptidase M22 glycoprotease  54.67 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725915  normal  0.446641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3853  peptidase M22, glycoprotease  45.79 
 
 
225 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4263  peptidase M22 glycoprotease  54.61 
 
 
230 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  42.86 
 
 
218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29230  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  43.52 
 
 
224 aa  124  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  58.21 
 
 
241 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2598  peptidase M22 glycoprotease  47.03 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0896201  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0358  peptidase M22, glycoprotease  42.27 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0837171 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  42.42 
 
 
229 aa  115  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  40.65 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2604  peptidase M22 glycoprotease  40.83 
 
 
223 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000523525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07480  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  41.82 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.308206  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0731  peptidase M22 glycoprotease  42.27 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0874562  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2894  peptidase M22, glycoprotease  40.44 
 
 
223 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3071  peptidase M22 glycoprotease  43.78 
 
 
222 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.255887  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23140  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  42.36 
 
 
244 aa  102  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2854  metalloendopeptidase, glycoprotease family  48.25 
 
 
891 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594224  normal  0.241498 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  31.33 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02240  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.25 
 
 
781 aa  93.2  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11790  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 
860 aa  91.7  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  38.16 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  29.57 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  34.87 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  31.96 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  35.06 
 
 
228 aa  89  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  31.3 
 
 
231 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  31.3 
 
 
231 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  31.3 
 
 
231 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  36.61 
 
 
233 aa  88.6  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  31.6 
 
 
233 aa  88.2  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0148  peptidase M22 glycoprotease  32.73 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  31.16 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  30.77 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  34.87 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  30.87 
 
 
231 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  30.87 
 
 
231 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16700  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  41.82 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.568455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  32.41 
 
 
233 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  31.03 
 
 
233 aa  85.9  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  35.04 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  34.03 
 
 
224 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  31.56 
 
 
233 aa  85.1  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  36.84 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  34.42 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  39.42 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  32.03 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  29.2 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  29.2 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  29.2 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  30 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  33.19 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  31.3 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  31.3 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  31.3 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  31.3 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  33.19 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  34.81 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  31.3 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  38.17 
 
 
231 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  38.17 
 
 
231 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  39.2 
 
 
235 aa  82  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  38.17 
 
 
231 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  38.17 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2125  hypothetical protein  37.9 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2088  hypothetical protein  37.9 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.5343  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  30.23 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  38.36 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  36.48 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  39.53 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  33.04 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  0.000000359774 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1663  hypothetical protein  37.9 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  40.31 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  39.58 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  40.28 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2665  peptidase M22, glycoprotease  42.98 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00483372  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  30.22 
 
 
233 aa  79  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  32.16 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  39.86 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  30.22 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  31.74 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  40.62 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>