51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1803 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
254 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0978  hypothetical protein  37.82 
 
 
284 aa  161  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0824  nucleotidyltransferase  33.99 
 
 
265 aa  156  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.388218  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0454  hypothetical protein  37.27 
 
 
292 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  27.34 
 
 
269 aa  92.4  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  26.25 
 
 
260 aa  89  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  23.98 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2178  aminoglycoside resistance protein  25.31 
 
 
295 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120718  normal  0.0590756 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  25.56 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  25.56 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  25.56 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  25.56 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  25.56 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  25.56 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  25.56 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0092  hypothetical protein  24.65 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.479287  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0063  aminoglycoside resistance protein  26.39 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0065  aminoglycoside resistance protein  26.98 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.577085 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0135  aminoglycoside resistance protein  26.98 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0144  aminoglycoside resistance protein  26.52 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.397995  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1385  aminoglycoside resistance protein  23.77 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.206124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3186  hypothetical protein  28.72 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1916  aminoglycoside resistance protein  23.77 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000483855  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1370  aminoglycoside resistance protein  23.36 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  hitchhiker  0.000262093 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1735  adenylyltransferase  24.65 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000530526  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1354  aminoglycoside resistance protein  23.36 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000229675  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2105  aminoglycoside resistance protein  23.27 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3549  aminoglycoside resistance protein  25.4 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5877  streptomycin 3''-adenylyltransferase  24.54 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0068  hypothetical protein  24 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01305  conserved hypothetical protein  25.2 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0466824  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4803  adenylyltransferase  25.91 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318391  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  24.77 
 
 
601 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2488  hypothetical protein  24.9 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3269  DNA polymerase beta domain protein region  24.26 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1526  hypothetical protein  23.5 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134054 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5184  nucleotidyltransferase domain-containing protein  23.44 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4819  nucleotidyltransferase domain-containing protein  23.44 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20670  nucleotidyltransferase family protein  22.02 
 
 
254 aa  48.5  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117962  normal  0.282766 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5054  nucleotidyltransferase domain protein  22.8 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4676  nucleotidyltransferase  24.23 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0150  nucleotidyltransferase domain protein  36.67 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4657  nucleotidyltransferase  23.32 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5092  nucleotidyltransferase domain protein  22.8 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5084  nucleotidyltransferase domain-containing protein  22.8 
 
 
295 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0296  DNA polymerase beta domain protein region  23.85 
 
 
271 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5090  nucleotidyltransferase domain protein  35 
 
 
264 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4769  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 
290 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  43.48 
 
 
113 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0571  DNA polymerase beta domain protein region  23.01 
 
 
257 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0047  nucleotidyltransferase domain-containing protein  21.68 
 
 
259 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>