More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1974 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1974  DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  100 
 
 
384 aa  796    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.953061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  48.44 
 
 
389 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16970  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  44.09 
 
 
391 aa  360  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0525  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  46.83 
 
 
395 aa  332  8e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4084  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  45.68 
 
 
392 aa  318  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.6 
 
 
368 aa  313  3.9999999999999997e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0593  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  44.09 
 
 
383 aa  311  2e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2405  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.13 
 
 
402 aa  291  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12432  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2305  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  41.3 
 
 
383 aa  291  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00668  UDP-bacillosamine synthetase  44.25 
 
 
383 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0252  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.35 
 
 
381 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0171  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.35 
 
 
381 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2587  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.27 
 
 
383 aa  275  9e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0384123  hitchhiker  0.000234634 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001802  putative aminotransferase DegT family  41.89 
 
 
383 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2329  pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis  43.07 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0047  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.64 
 
 
386 aa  272  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2633  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.25 
 
 
390 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152572  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3387  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.54 
 
 
381 aa  269  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3098  UDP-bacillosamine synthetase  40.81 
 
 
385 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.36 
 
 
384 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1461  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.4 
 
 
399 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1586  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.02 
 
 
382 aa  265  7e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.257863  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0369  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.4 
 
 
389 aa  262  8e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12411  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  39.69 
 
 
407 aa  262  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.485468  hitchhiker  0.0071561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3253  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.06 
 
 
384 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.28 
 
 
394 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14101  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  37.14 
 
 
398 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5132  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.28 
 
 
380 aa  257  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3402  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.85 
 
 
507 aa  255  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4858  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.9 
 
 
395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707328  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01121  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  41.39 
 
 
395 aa  252  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.273629 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.67 
 
 
379 aa  251  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.6 
 
 
372 aa  250  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0334323  normal  0.0133651 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0599  general glycosylation pathway protein  35.99 
 
 
386 aa  249  5e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1264  general glycosylation pathway protein  35.46 
 
 
386 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.905092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5394  aminotransferase family protein  35.16 
 
 
371 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0563  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.14 
 
 
381 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.73 
 
 
365 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.21 
 
 
372 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1139  general glycosylation pathway protein  35.73 
 
 
386 aa  247  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.957255  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0714  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.33 
 
 
375 aa  245  8e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0289  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.14 
 
 
367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1969  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.08 
 
 
384 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.886816  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2766  perosamine synthetase  39.11 
 
 
368 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0361  aminotransferase-like  34.91 
 
 
383 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.38 
 
 
368 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0950  putative perosamine synthetase  32.55 
 
 
365 aa  239  8e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.251305  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0448  processing protease  35.68 
 
 
363 aa  238  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3048  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.11 
 
 
382 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5255  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.67 
 
 
381 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1355  perosamine synthetase, putative  33.42 
 
 
364 aa  238  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0082  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.34 
 
 
371 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0080  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  36.34 
 
 
371 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.03 
 
 
362 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1257  UDP-4-keto-6-deoxy-GlcNAc C4 aminotransferase  32.32 
 
 
386 aa  236  6e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2345  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.28 
 
 
382 aa  235  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3119  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.57 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2975  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.57 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0792  hypothetical protein  35.26 
 
 
500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2521  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.06 
 
 
369 aa  233  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162044 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1203  putative perosamine synthetase  34.9 
 
 
363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0821  hypothetical protein  34.65 
 
 
500 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0521  perosamine synthase, putative  35.17 
 
 
367 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3061  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.11 
 
 
393 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2570  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.64 
 
 
372 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0312  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.7 
 
 
387 aa  226  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.991338  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10738  putative aminotransferase  35.03 
 
 
365 aa  226  6e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.250686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2624  perosamine synthase  36.2 
 
 
367 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1514  aminotransferase  35.73 
 
 
381 aa  224  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0334  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.06 
 
 
377 aa  223  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.272347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2970  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  34.91 
 
 
364 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000014581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3157  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.32 
 
 
371 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4223  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.58 
 
 
374 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0393  aminotransferase  34.6 
 
 
380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0711  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  33.42 
 
 
388 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1573  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.29 
 
 
500 aa  210  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0477  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.93 
 
 
364 aa  209  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1964  perosamine synthetase  32.55 
 
 
591 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0666  aminotransferase  32.55 
 
 
586 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0571  aminotransferase  32.55 
 
 
586 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  32.29 
 
 
591 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1589  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.41 
 
 
370 aa  203  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3378  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.65 
 
 
368 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.65764  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6415  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.26 
 
 
405 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.854254  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3652  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.59 
 
 
403 aa  196  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2836  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.61 
 
 
366 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281865  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0486  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34 
 
 
403 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1213  cell wall biosynthesis enzyme  30.41 
 
 
368 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.578129  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0594  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.87 
 
 
372 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.94 
 
 
371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18877  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0205  glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.26 
 
 
364 aa  190  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.737866  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0895  perosamine synthetase  33.5 
 
 
384 aa  190  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1120  polysaccharide biosynthesis protein  33.25 
 
 
382 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3059  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.82 
 
 
370 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3898  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.65 
 
 
388 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3035  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.75 
 
 
379 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181015  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3986  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.81 
 
 
383 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6219  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  33.5 
 
 
403 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.96406  normal  0.0916209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4213  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.87 
 
 
382 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1998  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.16 
 
 
389 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>