30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5571 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5571  methyltransferase  100 
 
 		 121 aa  238  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.766224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  54.31 
 
 		 212 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  51.28 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 215 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  46.96 
 
 		 209 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  44.83 
 
 		 218 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  47.37 
 
 		 224 aa  85.5  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  43.48 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  45.61 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  43.97 
 
 		 210 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  42.61 
 
 		 217 aa  80.1  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  40.7 
 
 		 222 aa  70.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  53.52 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  44.07 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  39.81 
 
 		 400 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.72 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  47.62 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  46.15 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  52.08 
 
 		 210 aa  51.2  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  41.79 
 
 		 197 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  39.47 
 
 		 219 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  33.33 
 
 		 200 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  42.31 
 
 		 359 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  41.3 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  42.22 
 
 		 200 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  37.8 
 
 		 305 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  46.88 
 
 		 294 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>