92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5096 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5096  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1416  hypothetical protein  51.79 
 
 		 149 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  0.064122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.2 
 
 		 274 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  35.8 
 
 		 311 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  35.2 
 
 		 177 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4211  hypothetical protein  32.4 
 
 		 135 aa  92.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4642  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  91.3  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.543378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1007  hypothetical protein  32.96 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0885  hypothetical protein  29.71 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11000  conserved hypothetical protein TIGR00026  32.75 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.94 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3783  hypothetical protein  27.27 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0482  hypothetical protein  30.86 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2511  hypothetical protein  41 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00847737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  29.95 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  29.95 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7866  hypothetical protein  32.16 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  29.95 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  30.11 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  30.11 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2212  hypothetical protein  27.53 
 
 		 144 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2106  hypothetical protein  27.78 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.334754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0042  hypothetical protein  29.03 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274125  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3972  hypothetical protein  28.34 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.604025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0833  hypothetical protein  38.75 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  26.92 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5065  hypothetical protein  23.76 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2630  hypothetical protein  26.7 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421408  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4680  hypothetical protein  23.76 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2675  hypothetical protein  26.7 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2659  hypothetical protein  26.7 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.463167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  26.73 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000649339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4766  hypothetical protein  23.76 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6160  hypothetical protein  27.22 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2616  hypothetical protein  25 
 
 		 149 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5388  hypothetical protein  27.49 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0956  hypothetical protein  26.7 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1090  hypothetical protein  46.15 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1187  hypothetical protein  27.32 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3827  hypothetical protein  31.36 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0978  hypothetical protein  40.79 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0266  hypothetical protein  41.56 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4989  hypothetical protein  27.49 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794366  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4153  hypothetical protein  25.99 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.89 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336696  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13199  hypothetical protein  36.36 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.190211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1505  hypothetical protein  22.22 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1364  hypothetical protein  29.61 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1126  hypothetical protein  28.07 
 
 		 147 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.726493  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5261  hypothetical protein  20.6 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1838  hypothetical protein  37.18 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1788  hypothetical protein  34.62 
 
 		 161 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  28.09 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0512  hypothetical protein  25.31 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0623  hypothetical protein  26.32 
 
 		 144 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11590  hypothetical protein  26.74 
 
 		 148 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.30585e-85  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1321  hypothetical protein  28.95 
 
 		 174 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.641608  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3144  hypothetical protein  25.44 
 
 		 145 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193303  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3084  hypothetical protein  25.44 
 
 		 145 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2352  hypothetical protein  26.67 
 
 		 150 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3104  hypothetical protein  25.44 
 
 		 145 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412887  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2023  hypothetical protein  25.15 
 
 		 145 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5872  hypothetical protein  34.67 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0817748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0257  hypothetical protein  36.92 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2015  hypothetical protein  28.03 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.364404  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2798  hypothetical protein  34.41 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00699009  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5225  hypothetical protein  26.62 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0749  hypothetical protein  26.92 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441888  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0743  hypothetical protein  26.92 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0763  hypothetical protein  26.92 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2620  hypothetical protein  26.92 
 
 		 148 aa  48.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00012961  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0254  hypothetical protein  25.79 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1480  hypothetical protein  24.85 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4640  hypothetical protein  32.47 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2085  hypothetical protein  35.71 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.776425  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4618  hypothetical protein  25.66 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4262  hypothetical protein  37.33 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.877042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6204  hypothetical protein  26.04 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2072  hypothetical protein  27.78 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.861634  normal  0.0346147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4457  hypothetical protein  26.26 
 
 		 152 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  35.48 
 
 		 360 aa  45.1  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1829  hypothetical protein  26.86 
 
 		 169 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349871  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1876  hypothetical protein  26.86 
 
 		 169 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0838475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1810  hypothetical protein  26.86 
 
 		 169 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0179461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  32.05 
 
 		 324 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1820  hypothetical protein  25 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1614  hypothetical protein  30.59 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0176  hypothetical protein  38.64 
 
 		 158 aa  42  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5840  hypothetical protein  30.11 
 
 		 143 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.765788  normal  0.503571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0985  hypothetical protein  24.56 
 
 		 145 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0468293  normal  0.0249112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0997  hypothetical protein  31.18 
 
 		 140 aa  41.2  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1823  hypothetical protein  29.73 
 
 		 154 aa  41.2  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00900716  normal  0.0800566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>