34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1805 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  100 
 
 		 168 aa  332  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  70.5 
 
 		 142 aa  195  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  58.87 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  51.2 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  50 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  51.64 
 
 		 139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  48.89 
 
 		 136 aa  134  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  54.1 
 
 		 138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  52.85 
 
 		 133 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  52.94 
 
 		 138 aa  127  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  51.59 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 139 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  52.63 
 
 		 131 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  50 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  52.25 
 
 		 140 aa  122  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  40.88 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  48.33 
 
 		 135 aa  117  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  46.09 
 
 		 131 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  43.75 
 
 		 146 aa  91.7  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  46.34 
 
 		 138 aa  90.9  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 139 aa  90.5  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  29.13 
 
 		 230 aa  48.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0155  response regulator receiver domain protein  29.29 
 
 		 233 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.37446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3596  two component transcriptional regulator  32.8 
 
 		 230 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  28 
 
 		 120 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>