203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1007 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1007  homoserine kinase  100 
 
 
317 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3723  homoserine kinase  61.21 
 
 
389 aa  328  7e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422816  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1201  homoserine kinase  53.57 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1650  Homoserine kinase  48.95 
 
 
336 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3936  homoserine kinase  55.19 
 
 
316 aa  255  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2422  homoserine kinase  49.36 
 
 
316 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  53.43 
 
 
310 aa  241  9e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3647  homoserine kinase  53.29 
 
 
309 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529848  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0632  homoserine kinase  51.96 
 
 
310 aa  236  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.305614  decreased coverage  0.0010744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  51.25 
 
 
317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4029  homoserine kinase  52.96 
 
 
314 aa  235  9e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29940  homoserine kinase  49.83 
 
 
291 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0320  homoserine kinase  46.71 
 
 
320 aa  225  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1300  homoserine kinase  48.89 
 
 
304 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19320  homoserine kinase  49.44 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4151  homoserine kinase  51.81 
 
 
321 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1283  homoserine kinase  50 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6154  homoserine kinase  51.52 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1232  homoserine kinase  48.91 
 
 
330 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2463  homoserine kinase  53.53 
 
 
310 aa  206  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1788  homoserine kinase  46.49 
 
 
317 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.542876  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09890  homoserine kinase  50.9 
 
 
315 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  43.17 
 
 
301 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2300  homoserine kinase  51.25 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  42.54 
 
 
300 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1746  homoserine kinase  49.34 
 
 
300 aa  199  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  41.95 
 
 
307 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  40.52 
 
 
308 aa  190  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3880  homoserine kinase  46.71 
 
 
314 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2621  homoserine kinase  43.87 
 
 
305 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1254  homoserine kinase  47.28 
 
 
328 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  47.76 
 
 
313 aa  185  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11323  homoserine kinase  46.31 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2354  homoserine kinase  44.3 
 
 
324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000501713 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3894  homoserine kinase  46.31 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3968  homoserine kinase  46.31 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353705  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  36.76 
 
 
304 aa  176  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4346  homoserine kinase  46.76 
 
 
314 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0197752  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1608  Homoserine kinase  37.47 
 
 
370 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2097  homoserine kinase  47.79 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  normal  0.0746509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  38.54 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  35.08 
 
 
307 aa  172  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1903  homoserine kinase  45.88 
 
 
336 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  37.06 
 
 
303 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  39.54 
 
 
297 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  41.64 
 
 
296 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  40.58 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1230  homoserine kinase  38.9 
 
 
355 aa  160  3e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  42.07 
 
 
306 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  37.55 
 
 
305 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  39.85 
 
 
304 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  37.18 
 
 
305 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  40.52 
 
 
302 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  38.66 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  28.52 
 
 
297 aa  153  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  34.27 
 
 
311 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  36.23 
 
 
303 aa  152  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  42.05 
 
 
297 aa  151  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0246  homoserine kinase  32 
 
 
294 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00137655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  42.48 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46461  predicted protein  35 
 
 
426 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  31.72 
 
 
300 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1495  homoserine kinase  31.7 
 
 
293 aa  142  5e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.122475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1835  homoserine kinase  32.89 
 
 
297 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.439683  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  36.77 
 
 
300 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  36.9 
 
 
315 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  37.27 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0147  homoserine kinase  33.47 
 
 
292 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00399009  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0129  homoserine kinase  32.91 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0169  homoserine kinase  32.91 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00243862  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  39.33 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  37.45 
 
 
302 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  35.96 
 
 
315 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10263  predicted protein  37.87 
 
 
265 aa  138  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111228  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  38.35 
 
 
317 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  35.38 
 
 
305 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  32.47 
 
 
304 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2050  homoserine kinase  44.19 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.189135  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  31.95 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1498  homoserine kinase  34.32 
 
 
297 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1972  homoserine kinase  32.44 
 
 
297 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0856158  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  39.55 
 
 
315 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2075  homoserine kinase  32.11 
 
 
297 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000541431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1784  homoserine kinase  32.11 
 
 
297 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  30.46 
 
 
294 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  30.23 
 
 
293 aa  135  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0950  homoserine kinase  43.4 
 
 
290 aa  135  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2053  homoserine kinase  31.07 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0296035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1827  homoserine kinase  32.11 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.115577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1801  homoserine kinase  32.11 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0151771  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  36.16 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  39.34 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1970  homoserine kinase  32.11 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.358252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3355  homoserine kinase  31.77 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000409306  hitchhiker  0.0000000000000103928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  44.27 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2004  homoserine kinase  32.11 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.268179999999999e-43 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  36.16 
 
 
315 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  32.25 
 
 
296 aa  132  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0220  homoserine kinase  28.33 
 
 
292 aa  129  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000123965  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2894  homoserine kinase  35 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.710654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>