87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4191 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4191  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  100 
 
 
229 aa  437  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6737  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  82.66 
 
 
509 aa  258  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291676  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3281  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  48.13 
 
 
518 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0194889 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3262  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  48.13 
 
 
518 aa  151  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00994132 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.31 
 
 
545 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.31 
 
 
545 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.31 
 
 
545 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.56 
 
 
546 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.56 
 
 
546 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3934  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  48.45 
 
 
399 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  47.8 
 
 
562 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7029  hypothetical protein  71.29 
 
 
144 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4953  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.31 
 
 
518 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12169  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6734  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.34 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6768  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.41 
 
 
501 aa  125  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403374  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5033  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.88 
 
 
570 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2991  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  49.25 
 
 
487 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3101  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  49.25 
 
 
487 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4601  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  49.25 
 
 
487 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3814  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.82 
 
 
549 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3974  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.45 
 
 
520 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.74 
 
 
511 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4809  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.82 
 
 
361 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5451  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.02 
 
 
536 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.268297 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  31.28 
 
 
539 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4192  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.76 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4212  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  40.72 
 
 
284 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  26.09 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.905986  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16150  transposase  35 
 
 
407 aa  62  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19680  transposase  35 
 
 
407 aa  62  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20460  transposase  35 
 
 
407 aa  62  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0995165  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05360  transposase family protein  29.14 
 
 
428 aa  61.6  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22120  transposase family protein  29.14 
 
 
428 aa  61.6  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523931  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26440  transposase family protein  29.14 
 
 
428 aa  61.6  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22250  transposase family protein  37.4 
 
 
457 aa  61.6  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0633  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  26.5 
 
 
157 aa  60.5  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.283421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3978  transposase  36.36 
 
 
107 aa  58.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.719199  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0739  hypothetical protein  33.64 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06565  hypothetical protein  25.85 
 
 
397 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4090  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.18 
 
 
441 aa  52  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04731  transposase TnpA, ISL3 family  26.42 
 
 
472 aa  51.6  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0781115  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4119  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.35 
 
 
417 aa  52  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3381  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  28.12 
 
 
152 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0803  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.68 
 
 
396 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0116  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.94 
 
 
421 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23490  transposase family protein  32.37 
 
 
454 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22400  transposase family protein  32.37 
 
 
454 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.323222  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05360  transposase family protein  32.37 
 
 
454 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.711648  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0746  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  28.12 
 
 
135 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0368  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.57 
 
 
441 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1079  ISL3 family transposase  36.23 
 
 
327 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.464356 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.13 
 
 
378 aa  48.9  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3384  hypothetical protein  25 
 
 
180 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0736  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.79 
 
 
431 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843016  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3098  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.97 
 
 
396 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0316374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1792  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.97 
 
 
396 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.333719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1367  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.97 
 
 
396 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00109866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1434  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.97 
 
 
396 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.458597  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.1 
 
 
438 aa  45.8  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3733  hypothetical protein  30.57 
 
 
339 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3125  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.95 
 
 
396 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1244  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.06 
 
 
361 aa  45.8  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.661907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1530  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  25.24 
 
 
146 aa  45.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.06 
 
 
406 aa  45.4  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0650816  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1438  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  20.1 
 
 
391 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2352  transposase ISL3 family protein  25.96 
 
 
440 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6415  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  26.06 
 
 
401 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779943  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4581  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.46 
 
 
436 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0738  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.46 
 
 
436 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0040  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.46 
 
 
436 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5991  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  26.06 
 
 
401 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0333  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.96 
 
 
441 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2862  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.96 
 
 
441 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3176  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.96 
 
 
441 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2279  hypothetical protein  34.33 
 
 
99 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  20.21 
 
 
391 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2328  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  20.21 
 
 
391 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3286  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  20.21 
 
 
391 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2445  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  20.21 
 
 
391 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.08593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1314  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  20.21 
 
 
391 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0565  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  20.21 
 
 
391 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0608  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  20.21 
 
 
391 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0649  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  20.21 
 
 
391 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3856  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  19.29 
 
 
391 aa  42.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0918  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  19.29 
 
 
391 aa  42.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2172  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.95 
 
 
407 aa  42  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2439  hypothetical protein  48.21 
 
 
225 aa  42  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.265104  normal  0.897623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>