215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4106 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 229 aa  457  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  57.73 
 
 		 219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  48.47 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  36.19 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  42.36 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  36.94 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  41.86 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  42.58 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  41.33 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  37.68 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  39.64 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  39.61 
 
 		 212 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  33.65 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  38.97 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  33.97 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  42.51 
 
 		 229 aa  128  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  34.13 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  34.13 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  33.47 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  33.49 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  35.27 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  33.48 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  35.75 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  33.17 
 
 		 243 aa  124  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  34.55 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  35.16 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  36.89 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  38.74 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  32.35 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  37.32 
 
 		 209 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  37.31 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  37.63 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  34.27 
 
 		 228 aa  115  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 		 244 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  30.09 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  36.59 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  36.89 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  36.89 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  36.89 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  35.05 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  34 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  39.11 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  33.82 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  36.06 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  36.54 
 
 		 270 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  34.31 
 
 		 216 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  28.44 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  35.12 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  33.02 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 233 aa  105  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  32.04 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 		 214 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  29.95 
 
 		 214 aa  105  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  34.48 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.34 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  33.67 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 		 207 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  32.83 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  34.16 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  31.6 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  32.55 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  33.04 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  32.23 
 
 		 220 aa  99  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 220 aa  98.6  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 220 aa  98.6  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 217 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  29.11 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  29.11 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  31.75 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  38.97 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  30.88 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  32.09 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  30.39 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  30.39 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 248 aa  95.5  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  31.34 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  30.35 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  29.91 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1026  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  34.23 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>