48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0179 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0179  putative acetyltransferase  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6889  hypothetical protein  65.17 
 
 		 195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0047  GCN5-related protein N-acetyltransferase  37.62 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3478  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  37.44 
 
 		 162 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7386  GCN5-related N-acetyltransferase  35.35 
 
 		 165 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13010  sortase-like acyltransferase  37.31 
 
 		 177 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0231  putative acetyltransferase  33.33 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.329835 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1769  acetyltransferase  33.17 
 
 		 165 aa  101  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000686927  normal  0.0139792 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1604  GCN5-related N-acetyltransferase  33.17 
 
 		 165 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.386581  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1499  acetyltransferase  32.67 
 
 		 165 aa  99.4  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.02186e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2899  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 		 178 aa  98.6  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1964  GCN5-related N-acetyltransferase  32.83 
 
 		 159 aa  95.9  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0200321 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  36.04 
 
 		 173 aa  93.6  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2343  GCN5-related N-acetyltransferase  32.66 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.632249  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2533  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 		 191 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177465  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  30.81 
 
 		 169 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.93894 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 		 171 aa  90.1  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.539427  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5882  GCN5-related N-acetyltransferase  33.84 
 
 		 160 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6796  GCN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 		 160 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5091  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 167 aa  89  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.839368 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5341  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 		 169 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4459  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 162 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3509  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475191  normal  0.0883622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  30.81 
 
 		 161 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 		 160 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 		 189 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2421  acetyltransferase  32.11 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2511  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.976863 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0104  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2061  GCN5-related N-acetyltransferase  31.31 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0996042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3603  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3954  GCN5-related N-acetyltransferase  33.16 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2307  putative acetyltransferase  34.86 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4322  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.21987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5025  GCN5-related N-acetyltransferase  34.76 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4429  GCN5-related N-acetyltransferase  31.31 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3274  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 189 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610284  normal  0.0661869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.63 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  23.98 
 
 		 168 aa  51.6  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000971374  normal  0.678083 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0403  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3278  GCN5-related N-acetyltransferase  21.69 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10460  sortase-like acyltransferase  21.2 
 
 		 160 aa  48.5  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81082  hitchhiker  0.0000000159699 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1711  GCN5-related N-acetyltransferase  20.44 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 166 aa  42  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>