65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3879 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3879  GDSL family lipase  100 
 
 
414 aa  851    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2643  lipolytic protein G-D-S-L family  52.15 
 
 
377 aa  396  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624519  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3061  GDSL family lipase  42.54 
 
 
415 aa  343  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3482  lipolytic protein G-D-S-L family  41.07 
 
 
409 aa  311  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1831  GDSL family lipase  41.75 
 
 
418 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0964  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.32 
 
 
407 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263974  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2273  lipolytic protein G-D-S-L family  37.11 
 
 
420 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4089  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09287  extracellular GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00820)  36.32 
 
 
425 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.879656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0961  GDSL family lipase  32.86 
 
 
439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1244  lipolytic protein G-D-S-L family  31.68 
 
 
404 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2556  lipolytic protein G-D-S-L family  32.31 
 
 
414 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  33.42 
 
 
542 aa  209  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14350  lysophospholipase L1-like esterase  35.01 
 
 
407 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3984  lipolytic protein G-D-S-L family  33.49 
 
 
430 aa  207  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.767273  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2328  lipolytic protein G-D-S-L family  30.71 
 
 
429 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  0.694344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1245  lipolytic protein G-D-S-L family  32.74 
 
 
414 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0233  GDSL family lipase  33.92 
 
 
421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000340097  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2776  lipolytic protein G-D-S-L family  34.84 
 
 
487 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20820  Lipolytic enzyme, G-D-S-L domain protein  32.09 
 
 
451 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1567  GDSL-like lipase/acylhydrolase family protein  34.03 
 
 
422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0013  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.98 
 
 
483 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000198  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3110  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.98 
 
 
483 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.000000000002324  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2571  lipase/acylhydrolase, putative  30.05 
 
 
425 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000716305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3539  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  30.05 
 
 
425 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000245982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1986  putative lipase/acylhydrolase  30.05 
 
 
425 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000018938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23690  putative secreted protein  30.81 
 
 
442 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903335 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0006  lipase/acylhydrolase, putative  29.81 
 
 
425 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000023586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2528  GDSL family lipase  31.75 
 
 
437 aa  193  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.744163 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3835  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  30.05 
 
 
425 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00947114  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3096  lipase/acylhydrolase, putative  29.11 
 
 
428 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0259  GDSL family lipase  32.57 
 
 
423 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511681  normal  0.138993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1595  lipolytic protein G-D-S-L family  31.01 
 
 
418 aa  188  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2775  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.16 
 
 
421 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000857041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0331  GDSL family lipase  33.16 
 
 
421 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4791  lipolytic protein G-D-S-L family  30.9 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2481  GDSL family lipase  30.45 
 
 
450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0311  GDSL family lipase  33.42 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000971594  hitchhiker  0.00755719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0250  GDSL family lipase  32.32 
 
 
421 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000480307  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7004  GDSL family lipase  29.81 
 
 
416 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  35.23 
 
 
794 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3430  lipolytic protein  32.32 
 
 
423 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000013234  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2664  GDSL family lipase  29.97 
 
 
423 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  decreased coverage  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4719  lipolytic protein G-D-S-L family  30 
 
 
407 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2856  GDSL family lipase  31.71 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000379569  hitchhiker  0.00852131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0297  lipase/acylhydrolase  30.28 
 
 
423 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223769  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4331  hypothetical protein  34.84 
 
 
326 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3660  lipolytic protein G-D-S-L family  30.95 
 
 
422 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000531698  hitchhiker  0.0000015866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  28.95 
 
 
646 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2832  lipolytic protein G-D-S-L family  30.86 
 
 
396 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000255461  decreased coverage  0.0000190518 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3774  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.41 
 
 
384 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000241856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2070  lipolytic protein G-D-S-L family  29.61 
 
 
395 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397214  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0237  hypothetical protein  25.45 
 
 
376 aa  120  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2838  lipolytic protein G-D-S-L family  24.94 
 
 
399 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.902078  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3614  lipolytic protein G-D-S-L family  32.37 
 
 
220 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  25.26 
 
 
1375 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.79 
 
 
183 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2847  GDSL family lipase  31.37 
 
 
230 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0175808  normal  0.606951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  28.4 
 
 
252 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  24.64 
 
 
331 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  24.75 
 
 
206 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  27.69 
 
 
596 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  26.94 
 
 
194 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0724  putative lipase  25.47 
 
 
573 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.52 
 
 
287 aa  43.5  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0711  lipolytic protein G-D-S-L family  26.09 
 
 
241 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>