54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2838 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2838  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
399 aa  793    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.902078  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3984  lipolytic protein G-D-S-L family  32.59 
 
 
430 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.767273  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23690  putative secreted protein  31.83 
 
 
442 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0961  GDSL family lipase  32.38 
 
 
439 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2556  lipolytic protein G-D-S-L family  29.79 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4791  lipolytic protein G-D-S-L family  30.79 
 
 
422 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2273  lipolytic protein G-D-S-L family  31.3 
 
 
420 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4089  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14350  lysophospholipase L1-like esterase  31.41 
 
 
407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1595  lipolytic protein G-D-S-L family  32.11 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2528  GDSL family lipase  31.94 
 
 
437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.744163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20820  Lipolytic enzyme, G-D-S-L domain protein  29.67 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2328  lipolytic protein G-D-S-L family  31.58 
 
 
429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  0.694344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1831  GDSL family lipase  30.18 
 
 
418 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3482  lipolytic protein G-D-S-L family  31.52 
 
 
409 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7004  GDSL family lipase  29.88 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4719  lipolytic protein G-D-S-L family  29.82 
 
 
407 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1244  lipolytic protein G-D-S-L family  27.89 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3061  GDSL family lipase  30.07 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2571  lipase/acylhydrolase, putative  31.63 
 
 
425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000716305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3539  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.63 
 
 
425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000245982  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3835  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  30.96 
 
 
425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00947114  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0013  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.83 
 
 
483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000198  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1986  putative lipase/acylhydrolase  31.63 
 
 
425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000018938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3110  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.83 
 
 
483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.000000000002324  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0006  lipase/acylhydrolase, putative  31.83 
 
 
425 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000023586  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3096  lipase/acylhydrolase, putative  30.42 
 
 
428 aa  113  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1567  GDSL-like lipase/acylhydrolase family protein  29.8 
 
 
422 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  28.29 
 
 
542 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2643  lipolytic protein G-D-S-L family  28.28 
 
 
377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624519  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09287  extracellular GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00820)  28.84 
 
 
425 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.879656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3879  GDSL family lipase  25.48 
 
 
414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2832  lipolytic protein G-D-S-L family  27.78 
 
 
396 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000255461  decreased coverage  0.0000190518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1245  lipolytic protein G-D-S-L family  28.39 
 
 
414 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2776  lipolytic protein G-D-S-L family  32.29 
 
 
487 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2856  GDSL family lipase  27.01 
 
 
452 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000379569  hitchhiker  0.00852131 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0237  hypothetical protein  22.76 
 
 
376 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2481  GDSL family lipase  26.95 
 
 
450 aa  99.8  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0964  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.24 
 
 
407 aa  99.8  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263974  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2070  lipolytic protein G-D-S-L family  27.81 
 
 
395 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397214  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0233  GDSL family lipase  29.68 
 
 
421 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000340097  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  27.32 
 
 
646 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2664  GDSL family lipase  25.18 
 
 
423 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  decreased coverage  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0259  GDSL family lipase  28.2 
 
 
423 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511681  normal  0.138993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0297  lipase/acylhydrolase  35.08 
 
 
423 aa  90.1  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223769  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3660  lipolytic protein G-D-S-L family  34.55 
 
 
422 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000531698  hitchhiker  0.0000015866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2775  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.32 
 
 
421 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000857041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0331  GDSL family lipase  27.32 
 
 
421 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381329  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0311  GDSL family lipase  27.32 
 
 
421 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000971594  hitchhiker  0.00755719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  26.98 
 
 
794 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0250  GDSL family lipase  35.08 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000480307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3430  lipolytic protein  36.04 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000013234  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3774  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.57 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000241856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3614  lipolytic protein G-D-S-L family  37.29 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4331  hypothetical protein  25.68 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>