55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2481 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2664  GDSL family lipase  92.91 
 
 		 423 aa  807    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  decreased coverage  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2481  GDSL family lipase  100 
 
 		 450 aa  917    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14350  lysophospholipase L1-like esterase  43.57 
 
 		 407 aa  292  9e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1244  lipolytic protein G-D-S-L family  39.81 
 
 		 404 aa  272  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3984  lipolytic protein G-D-S-L family  40.65 
 
 		 430 aa  259  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.767273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1245  lipolytic protein G-D-S-L family  39.52 
 
 		 414 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23690  putative secreted protein  38.96 
 
 		 442 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00903335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20820  Lipolytic enzyme, G-D-S-L domain protein  39.64 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2328  lipolytic protein G-D-S-L family  40.16 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  0.694344 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3061  GDSL family lipase  35.23 
 
 		 415 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3482  lipolytic protein G-D-S-L family  38.29 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2776  lipolytic protein G-D-S-L family  40.21 
 
 		 487 aa  236  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2273  lipolytic protein G-D-S-L family  36.97 
 
 		 420 aa  236  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0961  GDSL family lipase  37.96 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1831  GDSL family lipase  36.92 
 
 		 418 aa  230  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  36.23 
 
 		 542 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1595  lipolytic protein G-D-S-L family  39.22 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2643  lipolytic protein G-D-S-L family  38.83 
 
 		 377 aa  227  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2528  GDSL family lipase  37.08 
 
 		 437 aa  227  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2556  lipolytic protein G-D-S-L family  36.21 
 
 		 414 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1567  GDSL-like lipase/acylhydrolase family protein  37.69 
 
 		 422 aa  223  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  36.75 
 
 		 646 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0964  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.17 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7004  GDSL family lipase  36.6 
 
 		 416 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  34.94 
 
 		 794 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2856  GDSL family lipase  33.19 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000379569  hitchhiker  0.00852131 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4719  lipolytic protein G-D-S-L family  33.26 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0297  lipase/acylhydrolase  32.58 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3879  GDSL family lipase  30.18 
 
 		 414 aa  186  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3096  lipase/acylhydrolase, putative  29.93 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4791  lipolytic protein G-D-S-L family  34.11 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3110  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  30.4 
 
 		 483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.000000000002324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1986  putative lipase/acylhydrolase  30.4 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000018938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3539  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  30.4 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000245982  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0006  lipase/acylhydrolase, putative  30.4 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000023586  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2571  lipase/acylhydrolase, putative  30.4 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000716305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0013  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.4 
 
 		 483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000198  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4331  hypothetical protein  34.94 
 
 		 326 aa  180  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0233  GDSL family lipase  33.33 
 
 		 421 aa  179  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000340097  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3660  lipolytic protein G-D-S-L family  33.5 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000531698  hitchhiker  0.0000015866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2775  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.33 
 
 		 421 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000857041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0331  GDSL family lipase  33.33 
 
 		 421 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381329  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0259  GDSL family lipase  33.6 
 
 		 423 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511681  normal  0.138993 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3835  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.87 
 
 		 425 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00947114  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0311  GDSL family lipase  33.33 
 
 		 421 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000971594  hitchhiker  0.00755719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0250  GDSL family lipase  33.86 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000480307  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09287  extracellular GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00820)  31.22 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.879656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3430  lipolytic protein  32.02 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000013234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2070  lipolytic protein G-D-S-L family  33.69 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0237  hypothetical protein  28.09 
 
 		 376 aa  141  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2832  lipolytic protein G-D-S-L family  30.43 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000255461  decreased coverage  0.0000190518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3614  lipolytic protein G-D-S-L family  34.09 
 
 		 220 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3774  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.87 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000241856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2838  lipolytic protein G-D-S-L family  26.95 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.902078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1375 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>