61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3061 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3061  GDSL family lipase  100 
 
 
415 aa  829    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2643  lipolytic protein G-D-S-L family  51.05 
 
 
377 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0964  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.19 
 
 
407 aa  345  6e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263974  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3879  GDSL family lipase  42.54 
 
 
414 aa  343  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1831  GDSL family lipase  48.72 
 
 
418 aa  341  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3482  lipolytic protein G-D-S-L family  48.59 
 
 
409 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0961  GDSL family lipase  44.39 
 
 
439 aa  305  8.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14350  lysophospholipase L1-like esterase  43.28 
 
 
407 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2273  lipolytic protein G-D-S-L family  40.05 
 
 
420 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4089  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23690  putative secreted protein  40.05 
 
 
442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3984  lipolytic protein G-D-S-L family  40.94 
 
 
430 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.767273  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2528  GDSL family lipase  40.75 
 
 
437 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.744163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20820  Lipolytic enzyme, G-D-S-L domain protein  40.64 
 
 
451 aa  250  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2556  lipolytic protein G-D-S-L family  41.85 
 
 
414 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09287  extracellular GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00820)  38.04 
 
 
425 aa  249  7e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.879656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  36.83 
 
 
542 aa  249  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2776  lipolytic protein G-D-S-L family  39.79 
 
 
487 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1244  lipolytic protein G-D-S-L family  38.42 
 
 
404 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2664  GDSL family lipase  36.82 
 
 
423 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  decreased coverage  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2481  GDSL family lipase  36.02 
 
 
450 aa  236  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2328  lipolytic protein G-D-S-L family  38.31 
 
 
429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  0.694344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1595  lipolytic protein G-D-S-L family  36.54 
 
 
418 aa  229  9e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3096  lipase/acylhydrolase, putative  40.05 
 
 
428 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4719  lipolytic protein G-D-S-L family  38.76 
 
 
407 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4791  lipolytic protein G-D-S-L family  40 
 
 
422 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1567  GDSL-like lipase/acylhydrolase family protein  37.63 
 
 
422 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2571  lipase/acylhydrolase, putative  38.92 
 
 
425 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000716305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0006  lipase/acylhydrolase, putative  40.4 
 
 
425 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000023586  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1986  putative lipase/acylhydrolase  38.92 
 
 
425 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000018938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3539  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  38.92 
 
 
425 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000245982  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0013  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.92 
 
 
483 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000198  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3110  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  38.92 
 
 
483 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.000000000002324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  38.79 
 
 
794 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7004  GDSL family lipase  37.22 
 
 
416 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3835  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  38.68 
 
 
425 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00947114  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2856  GDSL family lipase  38.31 
 
 
452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000379569  hitchhiker  0.00852131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1245  lipolytic protein G-D-S-L family  38.35 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0297  lipase/acylhydrolase  38.13 
 
 
423 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223769  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0259  GDSL family lipase  37.44 
 
 
423 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511681  normal  0.138993 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0233  GDSL family lipase  37.02 
 
 
421 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000340097  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0250  GDSL family lipase  37.47 
 
 
421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000480307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0311  GDSL family lipase  37.4 
 
 
421 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000971594  hitchhiker  0.00755719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2775  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.15 
 
 
421 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000857041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0331  GDSL family lipase  37.15 
 
 
421 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381329  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3660  lipolytic protein G-D-S-L family  37.03 
 
 
422 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000531698  hitchhiker  0.0000015866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3430  lipolytic protein  36.36 
 
 
423 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000013234  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  33.83 
 
 
646 aa  176  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2070  lipolytic protein G-D-S-L family  34.75 
 
 
395 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397214  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3774  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.86 
 
 
384 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000241856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2832  lipolytic protein G-D-S-L family  33.15 
 
 
396 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000255461  decreased coverage  0.0000190518 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4331  hypothetical protein  34.88 
 
 
326 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0237  hypothetical protein  28.25 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3614  lipolytic protein G-D-S-L family  38.25 
 
 
220 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2838  lipolytic protein G-D-S-L family  29.1 
 
 
399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.902078  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  29.19 
 
 
1375 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0724  putative lipase  22.97 
 
 
573 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0740  alpha/beta hydrolase fold family protein  22.97 
 
 
573 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0142196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3633  hypothetical protein  42.11 
 
 
226 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  22.47 
 
 
279 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  27.98 
 
 
331 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.83 
 
 
183 aa  43.1  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>