76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4791 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4791  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 422 aa  843    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0961  GDSL family lipase  38.17 
 
 		 439 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3061  GDSL family lipase  39.67 
 
 		 415 aa  235  9e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1595  lipolytic protein G-D-S-L family  39.85 
 
 		 418 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  39.13 
 
 		 542 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20820  Lipolytic enzyme, G-D-S-L domain protein  39.08 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1831  GDSL family lipase  37 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2328  lipolytic protein G-D-S-L family  38.72 
 
 		 429 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  0.694344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23690  putative secreted protein  37.28 
 
 		 442 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00903335 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2643  lipolytic protein G-D-S-L family  39.55 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1244  lipolytic protein G-D-S-L family  38.02 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3984  lipolytic protein G-D-S-L family  36.75 
 
 		 430 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.767273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2556  lipolytic protein G-D-S-L family  37.9 
 
 		 414 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14350  lysophospholipase L1-like esterase  38.77 
 
 		 407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2273  lipolytic protein G-D-S-L family  35.9 
 
 		 420 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3482  lipolytic protein G-D-S-L family  36.59 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1567  GDSL-like lipase/acylhydrolase family protein  38.07 
 
 		 422 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0233  GDSL family lipase  38.8 
 
 		 421 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000340097  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3835  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  37.76 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00947114  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2571  lipase/acylhydrolase, putative  37.76 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000716305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3539  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  37.76 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000245982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1986  putative lipase/acylhydrolase  37.76 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000018938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0013  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.76 
 
 		 483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000198  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3110  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  37.76 
 
 		 483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.000000000002324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0311  GDSL family lipase  39 
 
 		 421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000971594  hitchhiker  0.00755719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2856  GDSL family lipase  35.84 
 
 		 452 aa  200  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000379569  hitchhiker  0.00852131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0006  lipase/acylhydrolase, putative  37.53 
 
 		 425 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000023586  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2775  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39 
 
 		 421 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000857041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0331  GDSL family lipase  39 
 
 		 421 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381329  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3096  lipase/acylhydrolase, putative  36.57 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0259  GDSL family lipase  37.9 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511681  normal  0.138993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3879  GDSL family lipase  30.7 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2528  GDSL family lipase  34.62 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2481  GDSL family lipase  34.11 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0964  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.99 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2664  GDSL family lipase  31.64 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  decreased coverage  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0250  GDSL family lipase  37.77 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000480307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3430  lipolytic protein  38.11 
 
 		 423 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000013234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1245  lipolytic protein G-D-S-L family  35.96 
 
 		 414 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09287  extracellular GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00820)  32.87 
 
 		 425 aa  188  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.879656 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7004  GDSL family lipase  35.77 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0297  lipase/acylhydrolase  35.76 
 
 		 423 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4719  lipolytic protein G-D-S-L family  34.16 
 
 		 407 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  34.62 
 
 		 794 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3660  lipolytic protein G-D-S-L family  36.18 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000531698  hitchhiker  0.0000015866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2776  lipolytic protein G-D-S-L family  31.61 
 
 		 487 aa  166  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  33.1 
 
 		 646 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2070  lipolytic protein G-D-S-L family  33.79 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0237  hypothetical protein  25.75 
 
 		 376 aa  149  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3774  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.9 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000241856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3614  lipolytic protein G-D-S-L family  42.59 
 
 		 220 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2838  lipolytic protein G-D-S-L family  30.7 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.902078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4331  hypothetical protein  34.19 
 
 		 326 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2832  lipolytic protein G-D-S-L family  30.21 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000255461  decreased coverage  0.0000190518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1375 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.77 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2847  GDSL family lipase  36.55 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0175808  normal  0.606951 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  26.67 
 
 		 216 aa  54.3  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  28.5 
 
 		 204 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3633  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  29.81 
 
 		 261 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2205  Arylesterase  32.09 
 
 		 185 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0724  putative lipase  20.83 
 
 		 573 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  29.41 
 
 		 217 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0740  alpha/beta hydrolase fold family protein  23.28 
 
 		 573 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0142196  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  27.88 
 
 		 203 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  32.12 
 
 		 215 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  28.32 
 
 		 728 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4506  lipolytic protein G-D-S-L family  28.11 
 
 		 230 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.66 
 
 		 287 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  28.11 
 
 		 230 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  25.36 
 
 		 208 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0762  lipolytic protein G-D-S-L family  24.12 
 
 		 222 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5427  putative lipase/acylhydrolase  22.5 
 
 		 269 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.387496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  31.01 
 
 		 255 aa  43.1  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  29.71 
 
 		 220 aa  43.1  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>