More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1729 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  593  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 
309 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  33.58 
 
 
326 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  32.5 
 
 
318 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.19 
 
 
305 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 
315 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 
309 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  31.38 
 
 
296 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  29.58 
 
 
316 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  31.03 
 
 
296 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.73 
 
 
314 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  26.88 
 
 
296 aa  96.3  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  31.08 
 
 
301 aa  95.5  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  30.69 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  28.71 
 
 
306 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  29.43 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  29.43 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  28.71 
 
 
306 aa  94  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  29.43 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  28.42 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  30.49 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  29.43 
 
 
306 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  30.13 
 
 
304 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  27.53 
 
 
296 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  27.53 
 
 
296 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  29.41 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  27.53 
 
 
296 aa  92.8  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  30.03 
 
 
304 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  26.44 
 
 
311 aa  92.4  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  30.19 
 
 
306 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  24.75 
 
 
309 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  29.25 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  28.91 
 
 
305 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  27.4 
 
 
310 aa  86.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  30.3 
 
 
305 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.67 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.01 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  29.93 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  24.6 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  24.6 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  29.93 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  28.57 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  24.6 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  24.6 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  24.6 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  24.6 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  24.6 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  28.91 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  24.41 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  29.15 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.62 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  29.93 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  23.23 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.89 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  24.27 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.34 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  28.34 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  29.69 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  28.34 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  24.41 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  23.45 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  28.34 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0747  hypothetical protein  24.74 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  28.34 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  24.27 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1228  hypothetical protein  24.74 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  28.96 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  24.41 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  25.99 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  24.32 
 
 
494 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1111  hypothetical protein  25.44 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948246  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1201  hypothetical protein  24.39 
 
 
402 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204073  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1110  hypothetical protein  25.24 
 
 
392 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4337  hypothetical protein  24.74 
 
 
414 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  26.42 
 
 
301 aa  79  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  27.05 
 
 
302 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  29.08 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  29.2 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  28.67 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  24.29 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  28.99 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  27.66 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  27.94 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  25.93 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  26.97 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  28.99 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  28.99 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2072  hypothetical protein  28.37 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  23.49 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  28.99 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  26.62 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  28.99 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  28.37 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  28.01 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>