22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0093 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0093  membrane protein-like protein  100 
 
 
667 aa  1370    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12710  predicted membrane protein  44.7 
 
 
662 aa  548  1e-154  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.942677  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27530  predicted membrane protein  41.19 
 
 
669 aa  504  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00352231  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1023  membrane protein-like protein  33.18 
 
 
660 aa  296  9e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1844  membrane protein-like protein  22.2 
 
 
598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.478995  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0361  hypothetical protein  24.46 
 
 
607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0735  hypothetical protein  23.1 
 
 
598 aa  100  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0169011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2259  membrane protein  23.59 
 
 
632 aa  79.7  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.158397  hitchhiker  0.00085756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0721  membrane protein-like protein  21.28 
 
 
573 aa  73.6  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1067  hypothetical protein  25.54 
 
 
756 aa  68.2  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  22.24 
 
 
649 aa  63.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2431  ribosomal protein S14  37.66 
 
 
561 aa  58.9  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2842  hypothetical protein  22.9 
 
 
675 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00272449  normal  0.0507641 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1065  hypothetical protein  26.77 
 
 
604 aa  54.3  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0119  hypothetical protein  35.59 
 
 
567 aa  53.5  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00804511  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2921  hypothetical protein  24.17 
 
 
581 aa  53.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0484  hypothetical protein  23.43 
 
 
498 aa  52.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0480409  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2464  hypothetical protein  23.76 
 
 
608 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0929  hypothetical protein  26.14 
 
 
547 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0961263  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0433  hypothetical protein  19.4 
 
 
613 aa  47.8  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.398189  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2446  hypothetical protein  23.68 
 
 
613 aa  45.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.767851  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2789  hypothetical protein  22.49 
 
 
297 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00516287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>