58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_0149 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0149  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
91 aa  187  5e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000244084  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0978  30S ribosomal protein S21  96.7 
 
 
90 aa  177  5.999999999999999e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3891  30S ribosomal protein S21  52.54 
 
 
68 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0666745 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0302  30S ribosomal protein S21  49.15 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2835  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0730941  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2287  30S ribosomal protein S21  49.15 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1043  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1422  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6850  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321881  normal  0.688892 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1951  30S ribosomal protein S21  49.15 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258071  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0246  30S ribosomal protein S21  52.63 
 
 
68 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2519  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1233  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110904  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3962  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1445  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.815794  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4656  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 
87 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0999  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3664  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159023  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0811  30S ribosomal protein S21  49.15 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3362  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17899  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0924  30S ribosomal protein S21  49.15 
 
 
79 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0294351  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0718  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
68 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0404324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2373  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
68 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2437  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
68 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0560968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3775  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0318  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124405  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2267  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399019  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2753  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 
71 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4259  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 
82 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2562  SSU ribosomal protein S21P  50.98 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3994  SSU ribosomal protein S21P  47.46 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.756973  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0906  30S ribosomal protein S21  52 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1391  30S ribosomal protein S21  52 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2800  30S ribosomal protein S21  52 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.556498  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0966  30S ribosomal protein S21  52 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14611  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3283  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 
67 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116244  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2067  ribosomal protein S21  50 
 
 
73 aa  50.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000824864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0900  30S ribosomal protein S21  49.02 
 
 
89 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6014  ribosomal protein S21  47.62 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1253  ribosomal protein S21  48 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193368  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4529  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3869  SSU ribosomal protein S21P  54.76 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174187  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7554  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 
99 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190009  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1039  30S ribosomal protein S21  54.76 
 
 
68 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823264  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0827  ribosomal protein S21  49.18 
 
 
64 aa  46.2  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0760536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0684  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.42682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1546  ribosomal protein S21  41.67 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.770446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1490  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4033  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734588  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5536  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725076  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3777  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0857629  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4580  30S ribosomal protein S21  45 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.44401  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4071  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1775  SSU ribosomal protein S21P  50 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000600029  decreased coverage  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2255  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000394301  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6336  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0373  30S ribosomal protein S21  50 
 
 
67 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0906  30S ribosomal protein S21  40.68 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>