More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3398 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 207 aa  427  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  96.14 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  95.65 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  95.65 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  95.65 
 
 		 207 aa  408  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  94.15 
 
 		 256 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  94.15 
 
 		 256 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  92.68 
 
 		 256 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  93.66 
 
 		 256 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  70.59 
 
 		 256 aa  310  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  71.08 
 
 		 256 aa  308  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  70.59 
 
 		 256 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  70.59 
 
 		 256 aa  307  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  67.8 
 
 		 256 aa  306  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  70.1 
 
 		 256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  61.27 
 
 		 257 aa  263  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  64.02 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  64 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  63.49 
 
 		 204 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  60.78 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  58.79 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  64.5 
 
 		 173 aa  234  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  55.17 
 
 		 255 aa  228  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  55.17 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  55.17 
 
 		 254 aa  221  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  54.68 
 
 		 254 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  55.28 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  54.19 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  58.24 
 
 		 187 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  50.25 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  50.25 
 
 		 259 aa  201  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  50.75 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  50.75 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  49.01 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  49.01 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  49.01 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  47.74 
 
 		 261 aa  193  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  49.25 
 
 		 259 aa  193  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  50.25 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  48.51 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  48.51 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  48.76 
 
 		 250 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  48.76 
 
 		 250 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  47.69 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  48.26 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  47.26 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  47.29 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  48.53 
 
 		 261 aa  184  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  47.26 
 
 		 250 aa  184  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  47.26 
 
 		 250 aa  184  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.03 
 
 		 251 aa  184  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  48.26 
 
 		 250 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.02 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.02 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  46.08 
 
 		 260 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  47.06 
 
 		 261 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  50.28 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  42.36 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.52 
 
 		 251 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.03 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.03 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.03 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  46.08 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.03 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  31.43 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.94 
 
 		 261 aa  101  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.35 
 
 		 258 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.35 
 
 		 258 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  32.35 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.87 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.76 
 
 		 261 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.18 
 
 		 261 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 264 aa  98.6  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  31.18 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.23 
 
 		 261 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.85 
 
 		 257 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.33 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.45 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3752  Methyltransferase type 11  34.36 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.51014  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.76 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.48 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.7 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.82 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  40.91 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  44.3 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  38.3 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1567  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.8 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00051335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  39.56 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  39.77 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>