45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0439 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  235  2e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  82.35 
 
 
119 aa  196  9e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  37.84 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  42.06 
 
 
240 aa  67.8  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  45.16 
 
 
149 aa  67  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  42.53 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  42.53 
 
 
137 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  42.53 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  38.24 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  40.66 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  39.42 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  37.27 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  52.08 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  36.36 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  34.38 
 
 
189 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  31.82 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  31 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  32.39 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  35.82 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  39.58 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  29.36 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  75 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  70.97 
 
 
116 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  28.18 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  40.82 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  56.76 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  33.77 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  65.71 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  29.91 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  32.1 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  32.08 
 
 
132 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  30.85 
 
 
145 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  68.97 
 
 
119 aa  42  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  65.71 
 
 
91 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  31.62 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  33.8 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  33 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  26.53 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  37.88 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  65.52 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  40.35 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  34 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  50 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  32.65 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>