41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1250 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
193 aa  387  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.9 
 
 
150 aa  155  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.07 
 
 
137 aa  142  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.67326e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  52.59 
 
 
139 aa  137  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.9 
 
 
152 aa  135  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.41 
 
 
142 aa  134  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  48.7 
 
 
135 aa  121  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  46.73 
 
 
155 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  47.83 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.93 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  38.21 
 
 
143 aa  88.2  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  3.44419e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 
144 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  33.09 
 
 
141 aa  78.2  7e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.61 
 
 
166 aa  77.8  9e-14  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  4.42476e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.86 
 
 
149 aa  77.8  1e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  30.26 
 
 
148 aa  75.5  5e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  36.7 
 
 
147 aa  69.3  3e-11  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  31.93 
 
 
142 aa  65.9  3e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  34.09 
 
 
141 aa  65.5  5e-10  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  34.58 
 
 
142 aa  65.1  6e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  34.78 
 
 
146 aa  65.1  6e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  34.26 
 
 
143 aa  63.2  2e-09  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  34.26 
 
 
143 aa  63.2  2e-09  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.46 
 
 
231 aa  61.2  8e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  39.29 
 
 
157 aa  59.7  3e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  37.14 
 
 
148 aa  58.9  5e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  30.89 
 
 
140 aa  56.6  2e-07  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  30.89 
 
 
140 aa  56.2  3e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  35.19 
 
 
142 aa  55.8  4e-07  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  29.52 
 
 
141 aa  53.5  2e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  27.73 
 
 
140 aa  52.8  3e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  51.6  7e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.98 
 
 
140 aa  48.5  6e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  26.73 
 
 
156 aa  48.1  7e-05  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  31.4 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.86 
 
 
137 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  29.41 
 
 
141 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  26.67 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.82 
 
 
112 aa  42.4  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>