More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1009 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 116 aa  233  6e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 138 aa  127  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  51.72 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  51.72 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  50 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 133 aa  123  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 113 aa  123  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 113 aa  123  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0652  ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3883  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4523  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  47.41 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 141 aa  120  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 141 aa  120  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  51.72 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 136 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 129 aa  120  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  50.86 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  49.14 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0863  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  49.14 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5054  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088451  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0515  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0510  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698201  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 142 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  50 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>